26 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ppro_2753 on replicon NC_008609
Organism: Pelobacter propionicus DSM 2379



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008609  Ppro_2753  nucleoside-diphosphate-sugar epimerase-like protein  100 
 
 
380 aa  766    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_44420  hypothetical protein  36.25 
 
 
779 aa  139  8.999999999999999e-32  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2132  protein of unknown function DUF1022  33.33 
 
 
334 aa  138  2e-31  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2765  nucleoside-diphosphate-sugar epimerase-like protein  35.64 
 
 
366 aa  135  1.9999999999999998e-30  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.368622  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1980  hypothetical protein  32.89 
 
 
334 aa  129  1.0000000000000001e-28  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.329271  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0478  protein of unknown function DUF1022  34.26 
 
 
328 aa  125  1e-27  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.327326  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2310  hypothetical protein  34.91 
 
 
335 aa  122  8e-27  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.488109  hitchhiker  0.00181536 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3079  nucleoside-diphosphate-sugar epimerase-like protein  30.03 
 
 
359 aa  107  3e-22  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.674528 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2143  hypothetical protein  30.74 
 
 
318 aa  101  2e-20  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.364693 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4294  hypothetical protein  35.1 
 
 
456 aa  99.8  7e-20  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.954414 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2684  hypothetical protein  30.45 
 
 
339 aa  94.4  3e-18  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.219268  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1025  protein of unknown function DUF1022  32.85 
 
 
361 aa  94.4  3e-18  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.607672  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0564  hypothetical protein  31.27 
 
 
349 aa  92.4  1e-17  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.327315  normal  0.0155833 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1091  hypothetical protein  32.49 
 
 
369 aa  91.7  2e-17  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.713738 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1220  protein of unknown function DUF1022  32.49 
 
 
374 aa  91.7  2e-17  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3794  hypothetical protein  34.64 
 
 
324 aa  85.1  0.000000000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.379056  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3359  protein of unknown function DUF1022  32.65 
 
 
323 aa  82.4  0.00000000000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.014075  normal  0.714541 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5826  protein of unknown function DUF1022  35.06 
 
 
342 aa  79.3  0.00000000000009  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.208847  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03908  hypothetical protein  31.84 
 
 
335 aa  74.7  0.000000000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0357  protein of unknown function DUF1022  30.77 
 
 
321 aa  69.7  0.00000000009  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.667044 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1127  hypothetical protein  29.86 
 
 
319 aa  65.9  0.000000001  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.330944  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1093  hypothetical protein  29.86 
 
 
319 aa  65.9  0.000000001  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1277  protein of unknown function DUF1022  30.05 
 
 
395 aa  57.8  0.0000003  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00000300037  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0476  nucleoside-diphosphate-sugar epimerase-like protein  23.96 
 
 
350 aa  53.9  0.000004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_5023  hypothetical protein  24.48 
 
 
323 aa  53.9  0.000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.63499  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1867  hypothetical protein  27.14 
 
 
327 aa  43.5  0.007  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>