12 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ppro_2579 on replicon NC_008609
Organism: Pelobacter propionicus DSM 2379



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008609  Ppro_2579  hypothetical protein  100 
 
 
208 aa  420  1e-117  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00000000382136  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2434  hypothetical protein  100 
 
 
249 aa  66.2  0.0000000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.255023  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2542  hypothetical protein  50.68 
 
 
225 aa  60.1  0.00000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2561  hypothetical protein  34.69 
 
 
169 aa  57  0.0000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000942752  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0748  hypothetical protein  39.47 
 
 
235 aa  48.1  0.0001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.407602  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2450  hypothetical protein  28.57 
 
 
179 aa  47  0.0002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.201479  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1766  hypothetical protein  64.52 
 
 
232 aa  47  0.0002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2481  protein of unknown function DUF1555  64.52 
 
 
232 aa  47  0.0002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1072  hypothetical protein  32.35 
 
 
205 aa  43.5  0.002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.114231  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3641  protein of unknown function DUF1555  56.67 
 
 
224 aa  42  0.006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2512  hypothetical protein  47.92 
 
 
188 aa  42  0.007  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.777055 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2627  hypothetical protein  81.25 
 
 
223 aa  41.6  0.009  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0778982  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>