16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ppro_0950 on replicon NC_008609
Organism: Pelobacter propionicus DSM 2379



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Replicon accession

Locus tag

Product

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Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

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E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008609  Ppro_0950  hypothetical protein  100 
 
 
86 aa  176  7e-44  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0248  hypothetical protein  67.44 
 
 
86 aa  127  4.0000000000000003e-29  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.727714  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5841  putative lipoprotein  45.88 
 
 
85 aa  88.2  3e-17  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_67460  putative lipoprotein  44.71 
 
 
85 aa  87  8e-17  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.52658  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0355  putative lipoprotein  46.34 
 
 
84 aa  85.5  3e-16  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0369  putative lipoprotein  45.12 
 
 
84 aa  82.8  0.000000000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5169  lipoprotein, putative  43.9 
 
 
84 aa  81.6  0.000000000000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0311  putative lipoprotein  41.18 
 
 
90 aa  75.9  0.0000000000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0426  lipoprotein  44.44 
 
 
84 aa  75.9  0.0000000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.613355  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5038  hypothetical protein  43.06 
 
 
84 aa  74.7  0.0000000000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4912  hypothetical protein  43.06 
 
 
84 aa  74.7  0.0000000000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5088  hypothetical protein  43.06 
 
 
84 aa  74.7  0.0000000000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.614342  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_45630  hypothetical protein  45 
 
 
84 aa  73.9  0.0000000000006  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.856651  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2268  hypothetical protein  32.93 
 
 
82 aa  70.9  0.000000000006  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.458864  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0510  hypothetical protein  42.42 
 
 
83 aa  70.1  0.000000000009  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
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NC_011138  MADE_02511  hypothetical protein  40.48 
 
 
100 aa  69.3  0.00000000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.441191  n/a   
 
 
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