74 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ppro_0372 on replicon NC_008609
Organism: Pelobacter propionicus DSM 2379



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008609  Ppro_0372  phage tail protein  100 
 
 
152 aa  312  9e-85  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3006  hypothetical protein  70.06 
 
 
157 aa  239  7e-63  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0680  hypothetical protein  71.61 
 
 
156 aa  234  4e-61  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.391136  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2465  hypothetical protein  65.79 
 
 
152 aa  206  1e-52  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.325818 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3923  hypothetical protein  58.67 
 
 
151 aa  187  5e-47  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.000169175  hitchhiker  0.00880657 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3151  phage tail protein  56.83 
 
 
142 aa  179  8.000000000000001e-45  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1039  hypothetical protein  52.11 
 
 
144 aa  169  1e-41  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3613  phage tail region protein  53.24 
 
 
146 aa  167  6e-41  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000436246 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5254  hypothetical protein  47.92 
 
 
147 aa  155  1e-37  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000600416 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0673  hypothetical protein  49.64 
 
 
143 aa  150  7e-36  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2546  conserved hypothetical phage tail protein  45.07 
 
 
146 aa  141  4e-33  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1686  hypothetical protein  45.77 
 
 
146 aa  141  4e-33  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2190  hypothetical protein  36.36 
 
 
145 aa  95.5  3e-19  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.376817  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2993  hypothetical protein  28.28 
 
 
150 aa  92.8  2e-18  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2820  phage tail protein  35.51 
 
 
142 aa  92  2e-18  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1959  hypothetical protein  32.85 
 
 
147 aa  86.3  1e-16  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.663764  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0976  hypothetical protein  39.13 
 
 
145 aa  86.3  1e-16  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2822  phage tail protein  37.96 
 
 
146 aa  84.7  4e-16  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1502  hypothetical protein  36.69 
 
 
147 aa  84.3  6e-16  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1658  phage tail protein  37.23 
 
 
146 aa  84.3  6e-16  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.664664  normal  0.0320443 
 
 
-
 
NC_009431  Rsph17025_4343  hypothetical protein  34.53 
 
 
141 aa  83.6  9e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0471416  normal  0.110764 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1660  phage tail protein  37.68 
 
 
142 aa  83.6  9e-16  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.274017  normal  0.160769 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1873  phage tail region protein  35 
 
 
146 aa  79  0.00000000000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0979  hypothetical protein  33.33 
 
 
146 aa  78.6  0.00000000000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.965809  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3817  phage tail protein  33.57 
 
 
146 aa  77  0.00000000000008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0125737  normal  0.215522 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1561  phage tail protein  30.46 
 
 
154 aa  76.3  0.0000000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.187603 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2547  conserved hypothetical phage tail protein  29.93 
 
 
147 aa  72.4  0.000000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0757  hypothetical protein  30.88 
 
 
150 aa  72  0.000000000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.122144  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1685  hypothetical protein  30.56 
 
 
145 aa  70.1  0.00000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0679  hypothetical protein  33.09 
 
 
152 aa  69.3  0.00000000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3005  hypothetical protein  28 
 
 
157 aa  69.3  0.00000000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3612  phage tail region protein  32.39 
 
 
147 aa  67.8  0.00000000005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000736395 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1881  hypothetical protein  38.21 
 
 
152 aa  67.4  0.00000000006  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0472148  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1505  hypothetical protein  32.85 
 
 
157 aa  67  0.00000000008  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2464  hypothetical protein  32.23 
 
 
160 aa  67  0.00000000009  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.240995 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0371  phage tail protein  33.82 
 
 
157 aa  67  0.00000000009  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0672  hypothetical protein  27.46 
 
 
146 aa  66.6  0.0000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1957  hypothetical protein  31.25 
 
 
178 aa  65.9  0.0000000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3037  phage tail protein  31.69 
 
 
147 aa  65.1  0.0000000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000349431 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2895  hypothetical protein  28.36 
 
 
179 aa  63.2  0.000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3661  hypothetical protein  32.39 
 
 
149 aa  62.8  0.000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0365523  hitchhiker  0.000649304 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5253  hypothetical protein  27.33 
 
 
154 aa  62.8  0.000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00063173 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1879  hypothetical protein  30.65 
 
 
154 aa  62  0.000000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0889335  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3924  hypothetical protein  30.22 
 
 
147 aa  60.5  0.000000008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.000187514  hitchhiker  0.00829413 
 
 
-
 
NC_009431  Rsph17025_4345  hypothetical protein  33.61 
 
 
172 aa  60.1  0.00000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0854635  normal  0.111661 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1040  phospholipid/glycerol acyltransferase  27.97 
 
 
148 aa  59.3  0.00000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3152  phage tail protein  27.52 
 
 
148 aa  58.5  0.00000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4388  hypothetical protein  27.21 
 
 
145 aa  58.2  0.00000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.345836 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0803  conserved hypothetical phage tail protein  27.08 
 
 
155 aa  57.4  0.00000007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.367058 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1420  hypothetical protein  29.01 
 
 
158 aa  57  0.0000001  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1630  conserved hypothetical phage tail protein  26.54 
 
 
182 aa  56.6  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.105626 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3039  phage tail protein  24.67 
 
 
160 aa  56.2  0.0000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000483158 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2939  hypothetical protein  33.33 
 
 
146 aa  55.8  0.0000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.230933  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0862  hypothetical protein  27.59 
 
 
176 aa  55.5  0.0000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.1019  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0802  conserved hypothetical phage tail protein  30.43 
 
 
159 aa  53.5  0.0000009  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.286471 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1823  phage tail protein  24.66 
 
 
171 aa  53.1  0.000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.338845  normal  0.202566 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1423  hypothetical protein  26.71 
 
 
160 aa  52  0.000003  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0656  hypothetical protein  25.34 
 
 
154 aa  50.8  0.000007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0846  hypothetical protein  25.34 
 
 
154 aa  50.4  0.000008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0831  hypothetical protein  24.31 
 
 
174 aa  50.4  0.00001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.339672  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5390  hypothetical protein  29.75 
 
 
147 aa  48.5  0.00003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5386  hypothetical protein  26.56 
 
 
143 aa  47.8  0.00005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_26560  conserved hypothetical phage tail region protein  26.28 
 
 
153 aa  47  0.00008  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  hitchhiker  0.00415635  normal  0.705478 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1055  hypothetical protein  23.91 
 
 
160 aa  47  0.0001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1900  hypothetical protein  28.57 
 
 
147 aa  45.1  0.0003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0408568  hitchhiker  0.00479184 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1904  hypothetical protein  27.41 
 
 
144 aa  45.4  0.0003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0753341  hitchhiker  0.00215477 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2265  hypothetical protein  24.81 
 
 
151 aa  44.7  0.0005  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.156187  hitchhiker  0.000466935 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1743  conserved hypothetical phage tail protein  25.87 
 
 
194 aa  44.3  0.0006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0761  hypothetical protein  26.71 
 
 
150 aa  44.3  0.0006  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  hitchhiker  0.00269614  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1728  conserved hypothetical phage tail protein  23.33 
 
 
167 aa  43.5  0.001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000263815 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2943  hypothetical protein  23.08 
 
 
141 aa  43.1  0.001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.159813  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0928  phage tail protein  24.48 
 
 
150 aa  43.5  0.001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0917106  normal  0.176994 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_26530  conserved hypothetical phage tail region protein  25.18 
 
 
159 aa  42.4  0.002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.167509  normal  0.504413 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0931  phage tail protein  24.43 
 
 
150 aa  42.4  0.002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.339945  normal  0.184767 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>