11 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ppha_2658 on replicon NC_011060
Organism: Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011060  Ppha_2658  hypothetical protein  100 
 
 		 81 aa  168  3e-41  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0823788  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0265  hypothetical protein  95.06 
 
 		 85 aa  163  8e-40  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1246  hypothetical protein  35.71 
 
 		 103 aa  51.6  0.000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.388474  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6037  Protein of unknown function DUF2442  44.12 
 
 		 81 aa  49.7  0.00001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1439  hypothetical protein  32.47 
 
 		 81 aa  49.3  0.00002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.766966  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1387  hypothetical protein  37.68 
 
 		 80 aa  45.4  0.0002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1342  hypothetical protein  37.68 
 
 		 80 aa  45.8  0.0002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1496  Protein of unknown function DUF2442  35.59 
 
 		 78 aa  45.4  0.0003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.367948  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1018  hypothetical protein  31.34 
 
 		 106 aa  43.9  0.0007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0617  hypothetical protein  31.82 
 
 		 90 aa  41.6  0.003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0271  hypothetical protein  22.22 
 
 		 88 aa  40.8  0.007  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>