13 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ppha_2191 on replicon NC_011060
Organism: Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011060  Ppha_2191  hypothetical protein  100 
 
 
106 aa  214  2e-55  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0610738  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0458  hypothetical protein  78.1 
 
 
106 aa  157  5e-38  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.291387  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1451  hypothetical protein  85.11 
 
 
54 aa  89.4  2e-17  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011061  Paes_2388  hypothetical protein  39 
 
 
120 aa  73.2  0.000000000001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00873498  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1226  hypothetical protein  36.47 
 
 
100 aa  66.6  0.0000000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0103498  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1320  hypothetical protein  37.65 
 
 
116 aa  63.5  0.0000000009  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2080  hypothetical protein  37.65 
 
 
116 aa  63.5  0.0000000009  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.23931  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4257  hypothetical protein  33.02 
 
 
113 aa  62.8  0.000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1034  hypothetical protein  31.58 
 
 
100 aa  55.8  0.0000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.754524 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1730  hypothetical protein  30.77 
 
 
113 aa  54.7  0.0000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2349  hypothetical protein  28.04 
 
 
123 aa  47.8  0.00005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0448  hypothetical protein  28.3 
 
 
127 aa  47  0.00009  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2256  hypothetical protein  24.14 
 
 
141 aa  43.5  0.001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>