11 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ppha_0348 on replicon NC_011060
Organism: Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011060  Ppha_0348  addiction module component, TIGR02574 family  100 
 
 
73 aa  149  1e-35  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0032  hypothetical protein  67.12 
 
 
92 aa  108  3e-23  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0056  hypothetical protein  47.95 
 
 
98 aa  77  0.00000000000008  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2372  addiction module component, TIGR02574 family  44.62 
 
 
77 aa  55.5  0.0000003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1759  addiction module component, TIGR02574 family  43.08 
 
 
76 aa  54.3  0.0000006  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1939  addiction module antitoxin  48.15 
 
 
86 aa  53.5  0.0000009  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1443  addiction module component, TIGR02574 family  38.1 
 
 
75 aa  53.5  0.0000009  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1572  addiction module component, TIGR02574 family  43.75 
 
 
69 aa  49.3  0.00002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4437  addiction module component  41.38 
 
 
70 aa  47.4  0.00007  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0133  hypothetical protein  33.9 
 
 
80 aa  45.1  0.0003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.000000000453704  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0061  addiction module component, TIGR02574 family  32.86 
 
 
74 aa  45.1  0.0003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>