18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pnap_1785 on replicon NC_008781
Organism: Polaromonas naphthalenivorans CJ2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008781  Pnap_1785  hypothetical protein  100 
 
 
176 aa  358  2e-98  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00316011 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1889  hypothetical protein  75 
 
 
176 aa  269  2e-71  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.887435 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1175  hypothetical protein  49.14 
 
 
179 aa  171  6.999999999999999e-42  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1428  hypothetical protein  46.67 
 
 
196 aa  166  1e-40  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2347  hypothetical protein  45.71 
 
 
202 aa  166  2e-40  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.80228  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0077  hypothetical protein  46.89 
 
 
179 aa  164  5e-40  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.100196  normal  0.541745 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1463  hypothetical protein  45.14 
 
 
202 aa  157  6e-38  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00619599 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3649  hypothetical protein  37.84 
 
 
196 aa  145  3e-34  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.286788 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7752  hypothetical protein  40.94 
 
 
275 aa  142  2e-33  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.384713  normal 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7807  hypothetical protein  40.35 
 
 
275 aa  140  9.999999999999999e-33  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.669348  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1228  hypothetical protein  36.81 
 
 
197 aa  134  5e-31  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000102813 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1510  hypothetical protein  36.81 
 
 
197 aa  134  5e-31  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0590557  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0411  hypothetical protein  36.76 
 
 
196 aa  134  6.0000000000000005e-31  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.515646  normal  0.176286 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5910  hypothetical protein  33.15 
 
 
202 aa  134  7.000000000000001e-31  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.8911  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0105  hypothetical protein  35.71 
 
 
195 aa  132  3.9999999999999996e-30  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.830414 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1213  hypothetical protein  25 
 
 
186 aa  52  0.000004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.0598646 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1419  hypothetical protein  24.68 
 
 
185 aa  47.4  0.0001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.307711 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_01360  hypothetical protein  24.85 
 
 
187 aa  45.4  0.0004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>