13 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pnap_0404 on replicon NC_008781
Organism: Polaromonas naphthalenivorans CJ2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008781  Pnap_0404  hypothetical protein  100 
 
 		 180 aa  342  2e-93  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.825315  normal  0.0195046 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5945  hypothetical protein  64.8 
 
 		 213 aa  209  2e-53  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.310759  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1048  hypothetical protein  37.88 
 
 		 154 aa  79.3  0.00000000000003  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1405  hypothetical protein  33.04 
 
 		 146 aa  62.4  0.000000003  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0704578 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_2088  hypothetical protein  29.85 
 
 		 195 aa  53.5  0.000002  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2404  hypothetical protein  29.85 
 
 		 195 aa  52.8  0.000002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.622357 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0812  hypothetical protein  28.12 
 
 		 322 aa  51.2  0.000007  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000531799  normal  0.0257293 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0827  hypothetical protein  28.12 
 
 		 314 aa  50.1  0.00002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0508348  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2796  hypothetical protein  31.43 
 
 		 179 aa  45.8  0.0003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.434133  normal  0.0812431 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4950  hypothetical protein  30.97 
 
 		 180 aa  45.8  0.0004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.483082 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2431  hypothetical protein  29.94 
 
 		 168 aa  44.7  0.0007  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1518  hypothetical protein  28.3 
 
 		 167 aa  42.7  0.003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.614963  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2249  hypothetical protein  28.93 
 
 		 190 aa  41.6  0.006  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000000367355  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>