14 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pmen_3701 on replicon NC_009439
Organism: Pseudomonas mendocina ymp



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009439  Pmen_3701  hypothetical protein  100 
 
 		 185 aa  374  1e-103  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2492  hypothetical protein  31.15 
 
 		 186 aa  119  1.9999999999999998e-26  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.122738  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0530  protein of unknown function DUF922  24.61 
 
 		 209 aa  70.9  0.00000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0183293  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0542  protein of unknown function DUF922  25.73 
 
 		 209 aa  70.5  0.00000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2184  protein of unknown function DUF922  25 
 
 		 208 aa  57.8  0.00000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.426082  normal  0.0144994 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2245  hypothetical protein  26.74 
 
 		 224 aa  54.3  0.000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.313687  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1972  protein of unknown function DUF922  23.26 
 
 		 208 aa  53.5  0.000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.416237 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1535  hypothetical protein  26.26 
 
 		 226 aa  51.2  0.000009  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4366  hypothetical protein  24.67 
 
 		 192 aa  50.1  0.00002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0206  secreted Zn-dependent protease-like protein  27.81 
 
 		 184 aa  49.3  0.00003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.376649  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0994  hypothetical protein  21.97 
 
 		 197 aa  45.4  0.0004  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2949  secreted Zn-dependent protease-like protein  27.16 
 
 		 210 aa  43.9  0.001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1028  hypothetical protein  21.79 
 
 		 206 aa  43.5  0.002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0750897  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0920  hypothetical protein  23.81 
 
 		 202 aa  43.5  0.002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.901036  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>