12 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pmen_3453 on replicon NC_009439
Organism: Pseudomonas mendocina ymp



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009439  Pmen_3453  hypothetical protein  100 
 
 		 175 aa  357  5e-98  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.346082  normal  0.520774 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3607  hypothetical protein  35.03 
 
 		 195 aa  87.8  7e-17  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.532303 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0440  hypothetical protein  41.3 
 
 		 199 aa  75.9  0.0000000000003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.465287 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3182  hypothetical protein  33.11 
 
 		 195 aa  75.5  0.0000000000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.0370737 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5965  hypothetical protein  38.3 
 
 		 202 aa  70.1  0.00000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.070499 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5645  hypothetical protein  31.29 
 
 		 201 aa  68.6  0.00000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0170  hypothetical protein  36.56 
 
 		 197 aa  67.4  0.0000000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3312  hypothetical protein  33.62 
 
 		 201 aa  65.5  0.0000000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6581  hypothetical protein  30.67 
 
 		 201 aa  65.1  0.0000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.483477  normal  0.0422786 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3959  hypothetical protein  33.33 
 
 		 181 aa  64.3  0.0000000007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2622  hypothetical protein  38.24 
 
 		 208 aa  56.2  0.0000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4813  hypothetical protein  30.19 
 
 		 202 aa  51.6  0.000006  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>