13 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pmen_3121 on replicon NC_009439
Organism: Pseudomonas mendocina ymp



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009439  Pmen_3121  hypothetical protein  100 
 
 		 108 aa  214  4e-55  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.310321  normal  0.0170994 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_30360  hypothetical protein  56.52 
 
 		 155 aa  65.1  0.0000000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2782  hypothetical protein  38.46 
 
 		 121 aa  60.8  0.000000005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.981039  normal  0.95643 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_45260  hypothetical protein  43.66 
 
 		 144 aa  57.4  0.00000006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3843  putative lipoprotein  43.66 
 
 		 137 aa  55.8  0.0000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3626  lipoprotein, putative  29.69 
 
 		 135 aa  51.6  0.000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3384  putative lipoprotein  41.79 
 
 		 135 aa  50.4  0.000007  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.112381  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3887  hypothetical protein  39.19 
 
 		 138 aa  50.8  0.000007  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1586  hypothetical protein  37.84 
 
 		 135 aa  50.4  0.000008  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.189764  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3644  hypothetical protein  40.54 
 
 		 139 aa  50.4  0.000008  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0205183  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4319  hypothetical protein  37.84 
 
 		 138 aa  48.9  0.00003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.860691  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1549  hypothetical protein  37.84 
 
 		 138 aa  48.5  0.00003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.51035  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1471  hypothetical protein  26.61 
 
 		 134 aa  46.2  0.0002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>