16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pmen_2209 on replicon NC_009439
Organism: Pseudomonas mendocina ymp



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009439  Pmen_2209  hypothetical protein  100 
 
 		 114 aa  232  1.0000000000000001e-60  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.116211  normal  0.0459101 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2393  hypothetical protein  37.5 
 
 		 113 aa  72.4  0.000000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.320552  hitchhiker  0.00184098 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3040  hypothetical protein  37.93 
 
 		 116 aa  59.7  0.00000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0019  hypothetical protein  32.65 
 
 		 115 aa  58.9  0.00000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.46801  normal  0.0246998 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0021  hypothetical protein  32.65 
 
 		 115 aa  58.9  0.00000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0019  hypothetical protein  34.12 
 
 		 94 aa  57  0.00000009  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.417471  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4012  hypothetical protein  41.25 
 
 		 81 aa  52.4  0.000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0316  putative lipoprotein  34.68 
 
 		 155 aa  51.2  0.000004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.956648  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0511  hypothetical protein  34.68 
 
 		 155 aa  50.8  0.000007  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0329  putative lipoprotein  34.68 
 
 		 155 aa  50.8  0.000007  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.738731  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3043  hypothetical protein  34.68 
 
 		 168 aa  50.4  0.000008  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2049  hypothetical protein  34.68 
 
 		 125 aa  50.4  0.000008  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3373  hypothetical protein  34.68 
 
 		 165 aa  50.1  0.000009  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5689  hypothetical protein  37.17 
 
 		 122 aa  49.7  0.00001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.118692  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5179  hypothetical protein  30.95 
 
 		 126 aa  47.8  0.00005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010070  Bmul_6285  hypothetical protein  33.07 
 
 		 125 aa  45.1  0.0004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.892062  normal  0.385427 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>