12 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pmen_1915 on replicon NC_009439
Organism: Pseudomonas mendocina ymp



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009439  Pmen_1915  hypothetical protein  100 
 
 		 255 aa  515  1.0000000000000001e-145  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0846835  normal  0.46148 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2335  hypothetical protein  64.98 
 
 		 257 aa  329  3e-89  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0156027  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_27590  hypothetical protein  64.59 
 
 		 257 aa  328  6e-89  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00959157 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1878  hypothetical protein  61.57 
 
 		 255 aa  301  7.000000000000001e-81  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.192229 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3837  hypothetical protein  61.18 
 
 		 280 aa  300  2e-80  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.41765 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1453  hypothetical protein  60.78 
 
 		 255 aa  298  7e-80  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.150556 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1487  hypothetical protein  61.96 
 
 		 255 aa  296  2e-79  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1785  hypothetical protein  59.38 
 
 		 256 aa  291  1e-77  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4191  hypothetical protein  63.49 
 
 		 252 aa  287  1e-76  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3609  hypothetical protein  58.27 
 
 		 252 aa  282  3.0000000000000004e-75  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.0064832  normal  0.347756 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1168  hypothetical protein  21.82 
 
 		 263 aa  68.2  0.0000000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000323941  hitchhiker  0.00000154553 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1768  hypothetical protein  22.57 
 
 		 256 aa  44.7  0.001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>