23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pmen_1740 on replicon NC_009439
Organism: Pseudomonas mendocina ymp



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009439  Pmen_1740  hypothetical protein  100 
 
 		 379 aa  743    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1776  LolC/E family lipoprotein releasing system, transmembrane protein  36.78 
 
 		 416 aa  134  3e-30  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0108802  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03578  putative orphan protein  29.82 
 
 		 441 aa  99.8  8e-20  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.000363918  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1835  hypothetical protein  28.08 
 
 		 336 aa  72  0.00000000002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.209638  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4029  putative CheA signal transduction histidine kinases  33.64 
 
 		 499 aa  58.2  0.0000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1301  hypothetical protein  40.24 
 
 		 205 aa  56.6  0.0000006  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0602  hypothetical protein  33.01 
 
 		 230 aa  56.2  0.0000008  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3351  hypothetical protein  33.01 
 
 		 230 aa  56.2  0.0000009  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2897  hypothetical protein  34.15 
 
 		 208 aa  53.1  0.000007  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3521  hypothetical protein  33.01 
 
 		 197 aa  53.1  0.000007  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0992  hypothetical protein  31.86 
 
 		 196 aa  52.8  0.00001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00757119 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0662  hypothetical protein  34.83 
 
 		 202 aa  52.8  0.00001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.117194  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0748  hypothetical protein  32.93 
 
 		 225 aa  51.6  0.00002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0857  hypothetical protein  32.26 
 
 		 199 aa  52  0.00002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3231  hypothetical protein  32.93 
 
 		 201 aa  51.2  0.00003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0808  hypothetical protein  30.51 
 
 		 179 aa  51.2  0.00003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0942  hypothetical protein  32.63 
 
 		 194 aa  51.2  0.00003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.971072  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3697  hypothetical protein  32.26 
 
 		 208 aa  50.4  0.00005  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.176724  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3821  hypothetical protein  32.26 
 
 		 208 aa  50.4  0.00005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.560519 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0634  hypothetical protein  31.4 
 
 		 205 aa  50.4  0.00005  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.536697  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3639  hypothetical protein  32.26 
 
 		 208 aa  50.4  0.00005  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.313555 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2013  hypothetical protein  36.36 
 
 		 194 aa  46.6  0.0007  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0205441  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1568  hypothetical protein  35.87 
 
 		 193 aa  45.4  0.002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00113128  hitchhiker  0.0000220315 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>