13 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pmen_0623 on replicon NC_009439
Organism: Pseudomonas mendocina ymp



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009439  Pmen_0623  HDOD  100 
 
 		 507 aa  989    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4954  hypothetical protein  55.31 
 
 		 511 aa  543  1e-153  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0560  hypothetical protein  55.31 
 
 		 511 aa  536  1e-151  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_65470  hypothetical protein  57.55 
 
 		 503 aa  525  1e-148  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0511  signal transduction protein  53.25 
 
 		 512 aa  525  1e-147  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.84731  normal  0.814528 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5684  HDOD domain-contain protein  57.34 
 
 		 503 aa  524  1e-147  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4906  metal-dependent hydrolase HDOD  52.76 
 
 		 511 aa  459  9.999999999999999e-129  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4782  metal-dependent hydrolase HDOD  53.15 
 
 		 511 aa  460  9.999999999999999e-129  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4959  metal-dependent hydrolase HDOD  52.95 
 
 		 511 aa  459  9.999999999999999e-129  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.840319 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4698  metal-dependent hydrolase HDOD  52.67 
 
 		 511 aa  458  9.999999999999999e-129  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2642  metal-dependent hydrolase HDOD  23.38 
 
 		 492 aa  46.6  0.001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.994556  hitchhiker  0.000160222 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1323  putative signal transduction protein  23.65 
 
 		 476 aa  46.2  0.002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.282046  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0557  putative signal transduction protein  24.27 
 
 		 477 aa  44.7  0.004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>