18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pmen_0595 on replicon NC_009439
Organism: Pseudomonas mendocina ymp



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009439  Pmen_0595  Mig-14 family protein  100 
 
 		 298 aa  608  1e-173  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4990  hypothetical protein  66.78 
 
 		 298 aa  426  1e-118  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0475  Mig-14  67.45 
 
 		 298 aa  427  1e-118  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.496349  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0530  Mig-14  66.44 
 
 		 298 aa  423  1e-117  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0825509  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5738  hypothetical protein  67.79 
 
 		 298 aa  420  1e-116  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_66150  hypothetical protein  66.44 
 
 		 298 aa  411  1e-114  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0526  Mig-14 family protein  64.31 
 
 		 298 aa  410  1e-113  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.254564  normal  0.164159 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4814  Mig-14 family protein  65.32 
 
 		 298 aa  410  1e-113  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4942  Mig-14 family protein  65.32 
 
 		 298 aa  410  1e-113  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4991  Mig-14 family protein  63.97 
 
 		 298 aa  405  1.0000000000000001e-112  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_44700  Mig-14 family protein  63.76 
 
 		 298 aa  388  1e-107  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.390095  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2893  Mig-14  23.78 
 
 		 298 aa  103  5e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2924  Mig-14  23.78 
 
 		 298 aa  102  7e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.0632699 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2958  hypothetical protein  23.43 
 
 		 298 aa  100  2e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.127053  hitchhiker  0.0000324409 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3080  Mig-14  23.43 
 
 		 298 aa  101  2e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2977  hypothetical protein  23.08 
 
 		 298 aa  100  3e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.291732 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1493  Mig-14 family protein  25.44 
 
 		 296 aa  92  1e-17  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.66727  normal  1 
 
 
-
 
NC_010488  EcSMS35_A0097  Mig-14 family protein  23.61 
 
 		 302 aa  89.7  5e-17  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.028214  hitchhiker  0.0000000164486 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>