18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plut_1597 on replicon NC_007512
Organism: Chlorobium luteolum DSM 273



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007512  Plut_1597  hypothetical protein  100 
 
 
369 aa  746    Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.509379 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0592  hypothetical protein  71.63 
 
 
368 aa  526  1e-148  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.60475  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1867  hypothetical protein  68.23 
 
 
449 aa  514  1e-144  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.0000000308254  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0720  hypothetical protein  66.94 
 
 
370 aa  510  1e-143  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0611  hypothetical protein  62.86 
 
 
375 aa  469  1.0000000000000001e-131  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.0811954 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0093  hypothetical protein  47.04 
 
 
361 aa  312  5.999999999999999e-84  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6603  hypothetical protein  37.12 
 
 
338 aa  173  5e-42  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.175733 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05140  hypothetical protein  33.42 
 
 
366 aa  142  9.999999999999999e-33  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1369  hypothetical protein  33.82 
 
 
366 aa  134  1.9999999999999998e-30  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.429385  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4849  hypothetical protein  24.93 
 
 
414 aa  95.5  1e-18  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.171892  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3719  hypothetical protein  33.73 
 
 
483 aa  87.8  3e-16  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.637839  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7754  hypothetical protein  33.83 
 
 
466 aa  79  0.0000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.904748  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1247  hypothetical protein  34.36 
 
 
560 aa  72.4  0.00000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.477424  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2547  hypothetical protein  28.92 
 
 
627 aa  70.9  0.00000000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.256267  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7173  hypothetical protein  31.18 
 
 
580 aa  69.7  0.00000000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.142604  normal  0.579785 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1604  hypothetical protein  34.4 
 
 
452 aa  68.2  0.0000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.523133 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3759  hypothetical protein  23.79 
 
 
461 aa  67.4  0.0000000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5988  hypothetical protein  34.45 
 
 
475 aa  52.4  0.00001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.075136  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>