46 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plim_1675 on replicon NC_014148
Organism: Planctomyces limnophilus DSM 3776



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014148  Plim_1675  GH3 auxin-responsive promoter  100 
 
 		 559 aa  1170    Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0953  GH3 auxin-responsive promoter  38.76 
 
 		 586 aa  407  1.0000000000000001e-112  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0561894  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2981  GH3 auxin-responsive promoter  28.52 
 
 		 557 aa  215  1.9999999999999998e-54  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4770  GH3 auxin-responsive promoter  29.39 
 
 		 581 aa  182  2e-44  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0973169  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2824  auxin-responsive GH3-related protein  26.06 
 
 		 487 aa  144  5e-33  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0537258  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4515  GH3 auxin-responsive promoter  27.2 
 
 		 526 aa  139  1e-31  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3833  GH3 auxin-responsive promoter  25.4 
 
 		 500 aa  139  2e-31  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.723154  normal  0.130127 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5924  GH3 auxin-responsive promoter  25.5 
 
 		 500 aa  137  7.000000000000001e-31  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3178  GH3 auxin-responsive promoter  25.42 
 
 		 510 aa  135  1.9999999999999998e-30  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.856999  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2176  hypothetical protein  25.34 
 
 		 509 aa  128  2.0000000000000002e-28  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2150  hypothetical protein  26.36 
 
 		 509 aa  128  2.0000000000000002e-28  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2698  GH3 auxin-responsive promoter  26.7 
 
 		 417 aa  120  3.9999999999999996e-26  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.797778  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1025  GH3 auxin-responsive promoter  21.82 
 
 		 494 aa  117  3.9999999999999997e-25  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2997  auxin-regulated protein  24.05 
 
 		 496 aa  116  1.0000000000000001e-24  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.42028 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2048  GH3 auxin-responsive promoter  22.64 
 
 		 497 aa  115  2.0000000000000002e-24  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02895  putative auxin-regulated protein  21.51 
 
 		 497 aa  112  2.0000000000000002e-23  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.380392  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1338  hypothetical protein  22.95 
 
 		 508 aa  112  2.0000000000000002e-23  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0190  GH3 auxin-responsive promoter  22.5 
 
 		 495 aa  110  5e-23  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.210438  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0468  hypothetical protein  22.37 
 
 		 502 aa  106  1e-21  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0752  GH3 auxin-responsive promoter  23.27 
 
 		 502 aa  104  4e-21  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1855  GH3 auxin-responsive protein  23.99 
 
 		 530 aa  99  2e-19  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0118  GH3 auxin-responsive promoter  23.18 
 
 		 508 aa  97.1  7e-19  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.086469 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3685  GH3 auxin-responsive promoter  22.61 
 
 		 502 aa  92.8  1e-17  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.46637  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0394  GH3 auxin-responsive promoter  24.31 
 
 		 547 aa  87.8  5e-16  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.20196  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1092  GH3 auxin-responsive promoter family protein  22.34 
 
 		 562 aa  84  0.000000000000006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0359437  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0144  GH3 auxin-responsive promoter  21.94 
 
 		 522 aa  83.2  0.00000000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.705042  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1720  hypothetical protein  22.65 
 
 		 509 aa  80.5  0.00000000000008  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3670  auxin-regulated protein  29.13 
 
 		 504 aa  77.4  0.0000000000007  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5651  GH3 auxin-responsive promoter  31.37 
 
 		 507 aa  72.8  0.00000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1713  GH3 auxin-responsive promoter  39.02 
 
 		 507 aa  72.4  0.00000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1478  GH3 auxin-responsive promoter  28.95 
 
 		 527 aa  72.4  0.00000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.173313 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0740  auxin-responsive GH3-related protein  30.41 
 
 		 532 aa  71.6  0.00000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.128908 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0473  GH3 auxin-responsive promoter  21.7 
 
 		 521 aa  71.2  0.00000000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0805  auxin-responsive GH3-related protein  29.68 
 
 		 514 aa  71.6  0.00000000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0949  GH3 auxin-responsive promoter  29.68 
 
 		 514 aa  71.6  0.00000000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.424251  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12318  hypothetical protein  22.92 
 
 		 507 aa  70.9  0.00000000006  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1542  hypothetical protein  33.67 
 
 		 128 aa  69.3  0.0000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0617  GH3 auxin-responsive promoter  22.68 
 
 		 528 aa  67.8  0.0000000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0495  GH3 auxin-responsive promoter  27.83 
 
 		 528 aa  65.5  0.000000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.5682  normal  0.527563 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00655  putative plant auxin-regulated protein  28.16 
 
 		 484 aa  64.3  0.000000005  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3419  GH3 auxin-responsive promoter  30.65 
 
 		 504 aa  64.3  0.000000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.0000000537388  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2573  GH3 auxin-responsive promoter  28.04 
 
 		 539 aa  63.9  0.000000008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1664  GH3 auxin-responsive promoter  23.05 
 
 		 514 aa  61.6  0.00000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.714218  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0869  GH3 auxin-responsive promoter  36.67 
 
 		 510 aa  57.4  0.0000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2660  auxin-regulated like  23.89 
 
 		 512 aa  57  0.000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1029  GH3 auxin-responsive promoter  25 
 
 		 510 aa  49.7  0.0001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.00063016  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>