47 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plim_0953 on replicon NC_014148
Organism: Planctomyces limnophilus DSM 3776



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014148  Plim_0953  GH3 auxin-responsive promoter  100 
 
 		 586 aa  1221    Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0561894  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1675  GH3 auxin-responsive promoter  38.76 
 
 		 559 aa  407  1.0000000000000001e-112  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4770  GH3 auxin-responsive promoter  28.76 
 
 		 581 aa  192  2e-47  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0973169  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2981  GH3 auxin-responsive promoter  28.25 
 
 		 557 aa  185  2.0000000000000003e-45  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2698  GH3 auxin-responsive promoter  29.17 
 
 		 417 aa  141  3e-32  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.797778  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2824  auxin-responsive GH3-related protein  24.76 
 
 		 487 aa  130  7.000000000000001e-29  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0537258  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4515  GH3 auxin-responsive promoter  25.83 
 
 		 526 aa  128  3e-28  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0740  auxin-responsive GH3-related protein  24.95 
 
 		 532 aa  125  2e-27  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.128908 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5924  GH3 auxin-responsive promoter  24.54 
 
 		 500 aa  112  2.0000000000000002e-23  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1855  GH3 auxin-responsive protein  26.02 
 
 		 530 aa  111  4.0000000000000004e-23  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2176  hypothetical protein  24.06 
 
 		 509 aa  108  2e-22  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2150  hypothetical protein  24.88 
 
 		 509 aa  107  4e-22  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5651  GH3 auxin-responsive promoter  23.8 
 
 		 507 aa  107  7e-22  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3670  auxin-regulated protein  23.53 
 
 		 504 aa  103  7e-21  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2048  GH3 auxin-responsive promoter  22.2 
 
 		 497 aa  102  2e-20  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3419  GH3 auxin-responsive promoter  24.48 
 
 		 504 aa  101  3e-20  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.0000000537388  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3833  GH3 auxin-responsive promoter  24.2 
 
 		 500 aa  101  5e-20  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.723154  normal  0.130127 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00655  putative plant auxin-regulated protein  23.44 
 
 		 484 aa  98.6  3e-19  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1713  GH3 auxin-responsive promoter  22.82 
 
 		 507 aa  96.7  1e-18  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0118  GH3 auxin-responsive promoter  24.26 
 
 		 508 aa  95.9  2e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.086469 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0869  GH3 auxin-responsive promoter  24 
 
 		 510 aa  93.6  1e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0394  GH3 auxin-responsive promoter  21.9 
 
 		 547 aa  92.4  2e-17  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.20196  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02895  putative auxin-regulated protein  21.51 
 
 		 497 aa  92  2e-17  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.380392  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0144  GH3 auxin-responsive promoter  24.28 
 
 		 522 aa  90.1  1e-16  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.705042  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1025  GH3 auxin-responsive promoter  21.15 
 
 		 494 aa  89.4  2e-16  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2997  auxin-regulated protein  24.67 
 
 		 496 aa  87.8  5e-16  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.42028 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0468  hypothetical protein  21.22 
 
 		 502 aa  80.9  0.00000000000006  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1478  GH3 auxin-responsive promoter  28.37 
 
 		 527 aa  75.9  0.000000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.173313 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0473  GH3 auxin-responsive promoter  23.01 
 
 		 521 aa  75.5  0.000000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG1720  hypothetical protein  27.12 
 
 		 509 aa  73.6  0.00000000001  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1664  GH3 auxin-responsive promoter  27.7 
 
 		 514 aa  69.7  0.0000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.714218  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0752  GH3 auxin-responsive promoter  26.56 
 
 		 502 aa  67  0.0000000008  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1029  GH3 auxin-responsive promoter  22.52 
 
 		 510 aa  67.4  0.0000000008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.00063016  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2660  auxin-regulated like  24.34 
 
 		 512 aa  66.6  0.000000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0495  GH3 auxin-responsive promoter  31.09 
 
 		 528 aa  67  0.000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.5682  normal  0.527563 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3685  GH3 auxin-responsive promoter  25.26 
 
 		 502 aa  65.5  0.000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.46637  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3178  GH3 auxin-responsive promoter  24.91 
 
 		 510 aa  64.3  0.000000005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.856999  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1338  hypothetical protein  26.02 
 
 		 508 aa  64.3  0.000000006  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0190  GH3 auxin-responsive promoter  22.68 
 
 		 495 aa  63.5  0.00000001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.210438  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1092  GH3 auxin-responsive promoter family protein  24.65 
 
 		 562 aa  62.4  0.00000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0359437  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12318  hypothetical protein  26.64 
 
 		 507 aa  60.8  0.00000006  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2573  GH3 auxin-responsive promoter  26.67 
 
 		 539 aa  58.2  0.0000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0949  GH3 auxin-responsive promoter  23.82 
 
 		 514 aa  57  0.000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.424251  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0805  auxin-responsive GH3-related protein  23.82 
 
 		 514 aa  57  0.000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0617  GH3 auxin-responsive promoter  25.74 
 
 		 528 aa  53.9  0.000008  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1160  hypothetical protein  24.5 
 
 		 543 aa  50.8  0.00006  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.104088  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1542  hypothetical protein  24.6 
 
 		 128 aa  47.8  0.0006  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>