21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plav_3522 on replicon NC_009719
Organism: Parvibaculum lavamentivorans DS-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009719  Plav_1213  hypothetical protein  100 
 
 		 55 aa  111  3e-24  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3522  hypothetical protein  100 
 
 		 55 aa  111  3e-24  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3023  hypothetical protein  84.91 
 
 		 55 aa  90.9  6e-18  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3068  hypothetical protein  81.13 
 
 		 55 aa  88.6  3e-17  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0767  hypothetical protein  72.22 
 
 		 93 aa  82.4  0.000000000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4582  hypothetical protein  68.52 
 
 		 66 aa  75.9  0.0000000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.890687  normal  0.353812 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4022  hypothetical protein  66.67 
 
 		 55 aa  73.9  0.0000000000006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.654387  normal  0.0665825 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0574  hypothetical protein  65.45 
 
 		 66 aa  73.6  0.0000000000009  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0658365  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0531  hypothetical protein  67.92 
 
 		 54 aa  72.4  0.000000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.248706  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1538  hypothetical protein  57.41 
 
 		 85 aa  64.7  0.0000000004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.0327376 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3834  hypothetical protein  53.57 
 
 		 57 aa  63.9  0.0000000008  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.100486  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2788  hypothetical protein  53.7 
 
 		 55 aa  55.1  0.0000003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0372  hypothetical protein  43.4 
 
 		 52 aa  48.5  0.00003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0261  hypothetical protein  46.94 
 
 		 58 aa  47.8  0.00005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2631  hypothetical protein  41.82 
 
 		 54 aa  47.4  0.00006  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4469  hypothetical protein  46.94 
 
 		 58 aa  46.6  0.0001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0726  hypothetical protein  55.56 
 
 		 80 aa  46.6  0.0001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.509331  normal  0.71288 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2499  hypothetical protein  39.62 
 
 		 80 aa  43.9  0.0007  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.421423  normal  1 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5530  hypothetical protein  42.55 
 
 		 56 aa  43.1  0.001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.101899 
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9156  Helicase subunit of the DNA excision repair complex  40.82 
 
 		 115 aa  40.8  0.005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3155  hypothetical protein  63.64 
 
 		 57 aa  40.4  0.009  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.245214  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>