13 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plav_3394 on replicon NC_009719
Organism: Parvibaculum lavamentivorans DS-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009719  Plav_3394  hypothetical protein  100 
 
 
130 aa  268  1e-71  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.557375  normal  0.0300431 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2307  hypothetical protein  98.46 
 
 
130 aa  266  1e-70  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.0000137352  hitchhiker  0.000138306 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1219  hypothetical protein  92.31 
 
 
130 aa  253  9e-67  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0344643  normal  0.41142 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1306  hypothetical protein  92.31 
 
 
130 aa  251  3e-66  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.586324  normal  0.526594 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1441  hypothetical protein  92.31 
 
 
130 aa  251  3e-66  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4153  hypothetical protein  90 
 
 
130 aa  248  2e-65  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.11154  normal  0.0419349 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0656  hypothetical protein  78.46 
 
 
130 aa  214  2.9999999999999998e-55  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.238511 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2349  hypothetical protein  73.85 
 
 
130 aa  204  3e-52  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.226748  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0988  hypothetical protein  73.85 
 
 
130 aa  204  3e-52  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.281845  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2230  hypothetical protein  73.08 
 
 
130 aa  203  6e-52  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0939122  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0553  hypothetical protein  69.23 
 
 
130 aa  193  5.000000000000001e-49  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2825  hypothetical protein  53.08 
 
 
129 aa  150  4e-36  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006365  plpp0065  hypothetical protein  28.57 
 
 
109 aa  63.9  0.0000000007  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>