66 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plav_2870 on replicon NC_009719
Organism: Parvibaculum lavamentivorans DS-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009719  Plav_2870  hypothetical protein  100 
 
 		 208 aa  419  1e-116  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0163842 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1855  hypothetical protein  39.6 
 
 		 210 aa  134  8e-31  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0470  hypothetical protein  35.05 
 
 		 200 aa  129  4.0000000000000003e-29  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.0466774  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0947  hypothetical protein  49.67 
 
 		 177 aa  128  7.000000000000001e-29  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5943  hypothetical protein  44.89 
 
 		 177 aa  127  1.0000000000000001e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0572526  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2630  hypothetical protein  38.2 
 
 		 191 aa  120  1.9999999999999998e-26  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.662517  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0658  hypothetical protein  37.13 
 
 		 190 aa  114  1.0000000000000001e-24  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.381208  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0651  hypothetical protein  37.13 
 
 		 190 aa  114  1.0000000000000001e-24  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.849018  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1399  hypothetical protein  34.67 
 
 		 218 aa  113  2.0000000000000002e-24  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.313439 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1148  hypothetical protein  37.97 
 
 		 196 aa  111  9e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2575  hypothetical protein  34.98 
 
 		 218 aa  108  5e-23  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.0291416 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0995  hypothetical protein  37.93 
 
 		 196 aa  106  3e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.855754 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0515  hypothetical protein  36.19 
 
 		 210 aa  106  3e-22  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0304  hypothetical protein  46.55 
 
 		 218 aa  105  5e-22  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.785913  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1671  hypothetical protein  46.55 
 
 		 218 aa  105  5e-22  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0195  hypothetical protein  44.92 
 
 		 218 aa  102  4e-21  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0679  hypothetical protein  36.57 
 
 		 210 aa  92.8  3e-18  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2564  hypothetical protein  41.75 
 
 		 234 aa  86.7  2e-16  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.164456  hitchhiker  0.00170184 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2062  hypothetical protein  28.39 
 
 		 173 aa  79  0.00000000000005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.687582  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4776  hypothetical protein  29.38 
 
 		 187 aa  78.2  0.00000000000008  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.146874 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1362  hypothetical protein  30.06 
 
 		 171 aa  77.4  0.0000000000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1583  hypothetical protein  32.39 
 
 		 178 aa  75.1  0.0000000000007  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_27551  hypothetical protein  41.38 
 
 		 167 aa  75.1  0.0000000000007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0502  hypothetical protein  29.73 
 
 		 210 aa  74.7  0.0000000000008  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000282211 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1133  hypothetical protein  34.13 
 
 		 228 aa  71.6  0.000000000007  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_02081  hypothetical protein  30.37 
 
 		 147 aa  69.7  0.00000000003  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.235056  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_02661  hypothetical protein  30.2 
 
 		 151 aa  68.9  0.00000000006  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1557  hypothetical protein  29.61 
 
 		 151 aa  68.6  0.00000000007  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2454  hypothetical protein  40.22 
 
 		 146 aa  68.2  0.00000000008  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2465  hypothetical protein  31.21 
 
 		 169 aa  68.2  0.00000000008  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.0000697447  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2137  hypothetical protein  39.13 
 
 		 162 aa  67  0.0000000002  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_02101  hypothetical protein  29.41 
 
 		 147 aa  66.2  0.0000000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.0337781  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0192  hypothetical protein  29.63 
 
 		 147 aa  66.2  0.0000000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.373494  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_02191  hypothetical protein  37.1 
 
 		 150 aa  63.5  0.000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1849  hypothetical protein  35.14 
 
 		 165 aa  60.5  0.00000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1507  hypothetical protein  31.9 
 
 		 208 aa  59.3  0.00000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_02081  hypothetical protein  35.34 
 
 		 149 aa  58.9  0.00000006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.817359  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4179  hypothetical protein  30.3 
 
 		 172 aa  58.2  0.00000008  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.764127 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1386  hypothetical protein  26.67 
 
 		 151 aa  58.2  0.00000008  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.01232  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3779  hypothetical protein  31.36 
 
 		 159 aa  56.6  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0390  hypothetical protein  28.57 
 
 		 160 aa  54.3  0.000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.371828  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3818  hypothetical protein  30.33 
 
 		 210 aa  54.7  0.000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0394  hypothetical protein  39.81 
 
 		 180 aa  52.4  0.000005  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1610  hypothetical protein  33.04 
 
 		 175 aa  52.4  0.000005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0380399  normal  0.147771 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2148  hypothetical protein  29.6 
 
 		 171 aa  52  0.000006  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.446802 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1584  hypothetical protein  33.94 
 
 		 185 aa  52  0.000006  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.452951  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0526  hypothetical protein  28.36 
 
 		 165 aa  52  0.000006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.983156  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3130  hypothetical protein  33.7 
 
 		 160 aa  52  0.000006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0121568  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1383  hypothetical protein  33.93 
 
 		 180 aa  50.8  0.00001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3780  uncharacterized protein-like protein  33.33 
 
 		 160 aa  51.2  0.00001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0161725  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1250  hypothetical protein  32.17 
 
 		 186 aa  50.4  0.00002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0557  hypothetical protein  29.63 
 
 		 171 aa  50.4  0.00002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.235942  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3586  hypothetical protein  30.87 
 
 		 165 aa  50.4  0.00002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000285245  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1472  hypothetical protein  30.65 
 
 		 212 aa  49.7  0.00004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_14720  hypothetical protein  28.26 
 
 		 175 aa  49.3  0.00005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  decreased coverage  0.00102497  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3864  uncharacterized protein-like protein  31.18 
 
 		 160 aa  48.9  0.00005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4133  hypothetical protein  31.52 
 
 		 160 aa  48.9  0.00006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000340149  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1745  hypothetical protein  24.18 
 
 		 163 aa  47.8  0.0001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0956  hypothetical protein  30.51 
 
 		 179 aa  46.6  0.0002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2176  hypothetical protein  28.32 
 
 		 177 aa  46.2  0.0004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_25470  hypothetical protein  28.32 
 
 		 177 aa  45.8  0.0004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1214  hypothetical protein  38.6 
 
 		 188 aa  44.3  0.001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1201  Protein of unknown function DUF2062  28.57 
 
 		 188 aa  43.9  0.002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.0952689 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2163  putative membrane protein with signal peptide  34.29 
 
 		 181 aa  42.7  0.003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00000423148  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2326  Protein of unknown function DUF2062  27.14 
 
 		 167 aa  41.6  0.008  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1152  Protein of unknown function DUF2062  28 
 
 		 165 aa  41.6  0.009  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>