31 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plav_1811 on replicon NC_009719
Organism: Parvibaculum lavamentivorans DS-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009719  Plav_1811  hypothetical protein  100 
 
 		 91 aa  184  3e-46  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.465355  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3343  hypothetical protein  53.85 
 
 		 92 aa  96.7  9e-20  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0429346  normal  0.933804 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7428  hypothetical protein  53.33 
 
 		 92 aa  96.3  1e-19  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0968962 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3913  hypothetical protein  54.65 
 
 		 92 aa  95.9  2e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1486  hypothetical protein  52.22 
 
 		 95 aa  95.1  3e-19  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1980  hypothetical protein  51.16 
 
 		 90 aa  93.2  1e-18  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.902774 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1038  hypothetical protein  51.11 
 
 		 92 aa  90.1  9e-18  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0983054  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3549  hypothetical protein  49.4 
 
 		 99 aa  83.2  0.000000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.242285  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2794  hypothetical protein  51.25 
 
 		 87 aa  81.6  0.000000000000004  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.617961  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3813  hypothetical protein  45.12 
 
 		 87 aa  80.5  0.000000000000007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.720082 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2328  hypothetical protein  47.13 
 
 		 100 aa  80.1  0.000000000000009  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.340966  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0367  hypothetical protein  49.37 
 
 		 87 aa  77.8  0.00000000000004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1516  hypothetical protein  49.35 
 
 		 87 aa  78.2  0.00000000000004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.184159 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0527  hypothetical protein  52.05 
 
 		 88 aa  76.3  0.0000000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.631272  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1208  hypothetical protein  50.65 
 
 		 86 aa  76.6  0.0000000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3527  hypothetical protein  50.65 
 
 		 86 aa  76.6  0.0000000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.239043  normal  0.797206 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4018  hypothetical protein  50.65 
 
 		 85 aa  75.9  0.0000000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.835397  normal  0.0668593 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0844  hypothetical protein  47.44 
 
 		 88 aa  74.7  0.0000000000004  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.0110114 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3072  hypothetical protein  42.05 
 
 		 88 aa  74.7  0.0000000000004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.288169  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3019  hypothetical protein  42.11 
 
 		 88 aa  74.7  0.0000000000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0762  hypothetical protein  45.05 
 
 		 91 aa  74.3  0.0000000000005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3680  hypothetical protein  52 
 
 		 87 aa  73.6  0.0000000000009  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0129  hypothetical protein  48.72 
 
 		 87 aa  73.6  0.0000000000009  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.280117  normal  0.660768 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3172  hypothetical protein  47.44 
 
 		 148 aa  73.2  0.000000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.868488 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0578  hypothetical protein  50.67 
 
 		 86 aa  73.2  0.000000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0767023  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3367  hypothetical protein  50.68 
 
 		 87 aa  72.4  0.000000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.104569 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0713  hypothetical protein  49.37 
 
 		 91 aa  71.6  0.000000000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.39863  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2865  hypothetical protein  44.19 
 
 		 91 aa  69.7  0.00000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.064843  normal  0.0210484 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3836  hypothetical protein  42.86 
 
 		 90 aa  68.9  0.00000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.071209  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3180  hypothetical protein  42.67 
 
 		 92 aa  66.2  0.0000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0603995  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7726  hypothetical protein  47.3 
 
 		 85 aa  63.2  0.000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0513086  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>