19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plav_0756 on replicon NC_009719
Organism: Parvibaculum lavamentivorans DS-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009719  Plav_0756  hypothetical protein  100 
 
 		 98 aa  194  3e-49  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.477341  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2379  hypothetical protein  50 
 
 		 88 aa  75.5  0.0000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.630868 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4329  hypothetical protein  50.7 
 
 		 88 aa  73.9  0.0000000000006  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.357967 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_4017  hypothetical protein  50 
 
 		 88 aa  72.4  0.000000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2702  hypothetical protein  47.14 
 
 		 88 aa  69.7  0.00000000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0227124  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1241  hypothetical protein  50 
 
 		 87 aa  69.7  0.00000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1126  hypothetical protein  48.48 
 
 		 87 aa  68.9  0.00000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.201713  normal  0.683214 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1259  hypothetical protein  46.38 
 
 		 87 aa  67.4  0.00000000007  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.220522  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1478  hypothetical protein  45.31 
 
 		 90 aa  55.5  0.0000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0685  hypothetical protein  36.59 
 
 		 87 aa  53.9  0.0000007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1756  hypothetical protein  35.71 
 
 		 87 aa  48.9  0.00002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.886984  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2616  hypothetical protein  26.58 
 
 		 85 aa  45.4  0.0002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.363218  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3986  hypothetical protein  40 
 
 		 84 aa  46.2  0.0002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00087868 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4819  hypothetical protein  37.84 
 
 		 84 aa  45.8  0.0002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.402358  normal  0.27545 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4301  hypothetical protein  38.81 
 
 		 99 aa  44.7  0.0005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.368926  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0663  hypothetical protein  26.58 
 
 		 88 aa  44.3  0.0005  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.358375  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0670  hypothetical protein  26.58 
 
 		 88 aa  44.3  0.0005  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4670  hypothetical protein  38.81 
 
 		 84 aa  43.9  0.0007  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.888175 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0708  hypothetical protein  30.38 
 
 		 89 aa  40.4  0.008  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.408327 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>