12 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plav_0741 on replicon NC_009719
Organism: Parvibaculum lavamentivorans DS-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009719  Plav_0741  hypothetical protein  100 
 
 		 290 aa  558  1e-158  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.560909 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0824  UspA domain protein  43 
 
 		 288 aa  77.8  0.0000000000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0929025  normal  0.400518 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1921  UspA domain protein  33.96 
 
 		 290 aa  76.6  0.0000000000005  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2089  UspA domain protein  37.75 
 
 		 298 aa  75.1  0.000000000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1928  hypothetical protein  40 
 
 		 263 aa  74.3  0.000000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.101794  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0297  hypothetical protein  33.9 
 
 		 273 aa  66.2  0.0000000005  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00164486 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2491  UspA domain protein  40.17 
 
 		 273 aa  65.1  0.000000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2124  hypothetical protein  31.76 
 
 		 284 aa  64.7  0.000000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00183225 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1516  UspA domain-containing protein  32.52 
 
 		 298 aa  56.2  0.0000006  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.360246  normal  0.6745 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2161  UspA domain-containing protein  29.03 
 
 		 280 aa  55.8  0.0000008  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.551312  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1016  UspA domain-containing protein  34.52 
 
 		 293 aa  52  0.00001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1718  UspA domain-containing protein  34.21 
 
 		 281 aa  52  0.00001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>