22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pisl_1895 on replicon NC_008701
Organism: Pyrobaculum islandicum DSM 4184



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008701  Pisl_1895  30S ribosomal protein S24e  100 
 
 		 123 aa  244  4e-64  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1197  30S ribosomal protein S24e  78.85 
 
 		 135 aa  181  3e-45  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0306  30S ribosomal protein S24e  75.49 
 
 		 128 aa  165  2e-40  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1438  30S ribosomal protein S24e  76.53 
 
 		 121 aa  164  4e-40  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.109359  normal  0.0262795 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0448  ribosomal protein S24e  39.78 
 
 		 106 aa  74.7  0.0000000000004  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0004  ribosomal protein S24E-like protein  40 
 
 		 155 aa  74.3  0.0000000000005  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1271  Ribosomal protein S24e  36.78 
 
 		 106 aa  62.8  0.000000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0881785  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1956  30S ribosomal protein S24e  34.34 
 
 		 103 aa  63.2  0.000000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3055  Ribosomal protein S24e  37.93 
 
 		 107 aa  62.4  0.000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2222  30S ribosomal protein S24e  32.14 
 
 		 113 aa  62  0.000000003  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00000329506 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1324  ribosomal protein S24e  38.71 
 
 		 99 aa  60.5  0.000000008  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0565  Ribosomal protein S24e  35.42 
 
 		 99 aa  60.1  0.00000001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1410  SSU ribosomal protein S24E (rps24E)  33.33 
 
 		 120 aa  60.1  0.00000001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1171  Ribosomal protein S24e  32.65 
 
 		 101 aa  55.5  0.0000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.538794  normal  0.934436 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2393  30S ribosomal protein S24e  33.33 
 
 		 102 aa  53.9  0.0000007  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2283  30S ribosomal protein S24e  34.48 
 
 		 102 aa  52.8  0.000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.000000399836  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0282  30S ribosomal protein S24e  32.95 
 
 		 101 aa  49.7  0.00001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_09097  37S ribosomal protein S24 (AFU_orthologue; AFUA_7G02140)  30.56 
 
 		 133 aa  45.1  0.0003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.133794  normal  0.364425 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0283  30S ribosomal protein S24e  29.9 
 
 		 102 aa  43.9  0.0007  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.568514  n/a   
 
 
-
 
NC_009042  PICST_87922  ribosomal protein S24  28.1 
 
 		 135 aa  43.5  0.001  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006686  CND04480  structural constituent of ribosome, putative  33.62 
 
 		 172 aa  41.2  0.005  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.287785  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2866  ribosomal protein S24e  30.43 
 
 		 112 aa  40.4  0.008  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0232218  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>