17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pisl_0384 on replicon NC_008701
Organism: Pyrobaculum islandicum DSM 4184



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008701  Pisl_0384  GTP cyclohydrolase IIA  100 
 
 
221 aa  458  9.999999999999999e-129  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal  0.22559 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1743  GTP cyclohydrolase IIA  63.35 
 
 
221 aa  310  1e-83  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal  0.0670897 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1351  GTP cyclohydrolase IIA  53.39 
 
 
221 aa  270  1e-71  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.0394455 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1123  GTP cyclohydrolase IIA  56.56 
 
 
221 aa  262  4e-69  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.821112 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1377  GTP cyclohydrolase IIa  31.84 
 
 
231 aa  105  8e-22  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0982803  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0049  GTP cyclohydrolase IIA  31.65 
 
 
230 aa  100  1e-20  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.0787957  normal  0.474293 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2188  GTP cyclohydrolase III  25.63 
 
 
257 aa  79.3  0.00000000000004  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0683488  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0818  GTP cyclohydrolase III  26.14 
 
 
272 aa  78.2  0.0000000000001  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.755555  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1614  GTP cyclohydrolase IIA  25 
 
 
251 aa  76.3  0.0000000000004  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1393  GTP cyclohydrolase III  24.9 
 
 
266 aa  75.5  0.0000000000007  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1233  GTP cyclohydrolase III  23.75 
 
 
266 aa  70.1  0.00000000002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0458897  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3329  GTP cyclohydrolase IIa  23.33 
 
 
254 aa  68.2  0.0000000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.828115  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1998  GTP cyclohydrolase III  25.1 
 
 
268 aa  68.2  0.0000000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.440249  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0505  GTP cyclohydrolase III  23.33 
 
 
266 aa  67.4  0.0000000001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1403  GTP cyclohydrolase III  23.33 
 
 
266 aa  66.6  0.0000000003  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1598  GTP cyclohydrolase IIa  21.77 
 
 
253 aa  65.9  0.0000000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2633  GTP cyclohydrolase IIa  24.79 
 
 
253 aa  64.3  0.000000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.808385  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>