21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ping_2502 on replicon NC_008709
Organism: Psychromonas ingrahamii 37



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008709  Ping_2502    100 
 
 		 1090 bp  2161    Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.674339  normal  0.0724762 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1695    92.46 
 
 		 1086 bp  771    Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.165602  normal  0.365956 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2326    87.17 
 
 		 420 bp  373  1e-101  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.855108 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2002    91.01 
 
 		 756 bp  333  6e-89  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.923889 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1781    87.85 
 
 		 382 bp  184  4e-44  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.582267  normal  0.331336 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1693    85.56 
 
 		 1055 bp  151  5e-34  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.514185  normal  0.247616 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2357    86.29 
 
 		 261 bp  111  4e-22  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.72969  hitchhiker  0.0017975 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3096    89.52 
 
 		 215 bp  105  3e-20  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.0383696 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2044  hypothetical protein  88.42 
 
 		 282 bp  101  4e-19  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0218821  normal  0.592875 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0324    80.92 
 
 		 1072 bp  81.8  0.0000000000004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1775    93.62 
 
 		 370 bp  69.9  0.000000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.47842 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2043    84.88 
 
 		 292 bp  67.9  0.000000006  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0209259  normal  0.428635 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4372    81.58 
 
 		 808 bp  60  0.000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4132  hypothetical protein  82.65 
 
 		 984 bp  60  0.000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1385  hypothetical protein  82.65 
 
 		 984 bp  60  0.000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.868466  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2822    87.04 
 
 		 526 bp  52  0.0003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.348547  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1848  hypothetical protein  81.63 
 
 		 984 bp  52  0.0003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0907  hypothetical protein  88 
 
 		 984 bp  52  0.0003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0248219  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0052  hypothetical protein  90.24 
 
 		 981 bp  50.1  0.001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.186799 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3677    96.55 
 
 		 902 bp  50.1  0.001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3676    96.55 
 
 		 1107 bp  50.1  0.001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>