18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ping_2002 on replicon NC_008709
Organism: Psychromonas ingrahamii 37



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008709  Ping_2002    100 
 
 		 756 bp  1499    Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.923889 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1695    83.28 
 
 		 1086 bp  404  9.999999999999999e-111  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.165602  normal  0.365956 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2502    91.01 
 
 		 1090 bp  333  4e-89  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.674339  normal  0.0724762 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2043    81.95 
 
 		 292 bp  133  8.000000000000001e-29  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0209259  normal  0.428635 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1693    92.71 
 
 		 1055 bp  129  1e-27  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.514185  normal  0.247616 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2357    85.33 
 
 		 261 bp  123  7.999999999999999e-26  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.72969  hitchhiker  0.0017975 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4372    91.23 
 
 		 808 bp  73.8  0.00000000006  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1903    86.49 
 
 		 294 bp  67.9  0.000000004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.475323  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2822    90.2 
 
 		 526 bp  61.9  0.0000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.348547  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1891  hypothetical protein  89.09 
 
 		 282 bp  61.9  0.0000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0968577  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1775    88.14 
 
 		 370 bp  61.9  0.0000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.47842 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0324    82.05 
 
 		 1072 bp  60  0.000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3677    85.14 
 
 		 902 bp  60  0.000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3676    85.14 
 
 		 1107 bp  60  0.000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4132  hypothetical protein  81.63 
 
 		 984 bp  52  0.0002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1385  hypothetical protein  81.63 
 
 		 984 bp  52  0.0002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.868466  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1848  hypothetical protein  90 
 
 		 984 bp  48.1  0.004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2022    90 
 
 		 981 bp  48.1  0.004  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.286308  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>