20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ping_1695 on replicon NC_008709
Organism: Psychromonas ingrahamii 37



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008709  Ping_2502    92.46 
 
 		 1090 bp  771    Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.674339  normal  0.0724762 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1695    100 
 
 		 1086 bp  2153    Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.165602  normal  0.365956 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2002    83.28 
 
 		 756 bp  404  9.999999999999999e-111  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.923889 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1781    87.36 
 
 		 382 bp  341  2.9999999999999997e-91  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.582267  normal  0.331336 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2326    86.21 
 
 		 420 bp  274  5e-71  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.855108 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3096    89.76 
 
 		 215 bp  149  2e-33  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.0383696 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1693    93.26 
 
 		 1055 bp  129  2e-27  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.514185  normal  0.247616 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0324    81.76 
 
 		 1072 bp  91.7  4e-16  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2044  hypothetical protein  86.32 
 
 		 282 bp  85.7  0.00000000000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0218821  normal  0.592875 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1775    86.32 
 
 		 370 bp  85.7  0.00000000000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.47842 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2357    78.71 
 
 		 261 bp  73.8  0.00000000009  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.72969  hitchhiker  0.0017975 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2043    82.17 
 
 		 292 bp  73.8  0.00000000009  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0209259  normal  0.428635 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3677    86.84 
 
 		 902 bp  71.9  0.0000000004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3676    86.84 
 
 		 1107 bp  71.9  0.0000000004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2822    91.67 
 
 		 526 bp  63.9  0.00000009  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.348547  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4372    90.2 
 
 		 808 bp  61.9  0.0000004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4132  hypothetical protein  81.63 
 
 		 984 bp  52  0.0003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1385  hypothetical protein  81.63 
 
 		 984 bp  52  0.0003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.868466  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02418  hypothetical protein  92.11 
 
 		 987 bp  52  0.0003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1848  hypothetical protein  90 
 
 		 984 bp  48.1  0.005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>