80 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ping_0898 on replicon NC_008709
Organism: Psychromonas ingrahamii 37



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008709  Ping_0898  hypothetical protein  100 
 
 		 169 aa  342  1e-93  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.749286 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1817  hypothetical protein  57.14 
 
 		 168 aa  209  1e-53  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0392533  normal  0.0810323 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1666  hypothetical protein  59.17 
 
 		 169 aa  208  2e-53  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.257609  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1681  hypothetical protein  59.17 
 
 		 169 aa  208  2e-53  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1703  hypothetical protein  59.17 
 
 		 169 aa  208  2e-53  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.176608  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2676  hypothetical protein  59.17 
 
 		 169 aa  208  2e-53  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.036415 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1555  hypothetical protein  57.4 
 
 		 169 aa  204  4e-52  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2586  hypothetical protein  57.4 
 
 		 169 aa  204  5e-52  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.757893  normal  0.0816334 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2804  hypothetical protein  57.4 
 
 		 169 aa  203  8e-52  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2390  hypothetical protein  55.62 
 
 		 169 aa  203  1e-51  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.194438  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1768  hypothetical protein  57.74 
 
 		 168 aa  202  2e-51  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.254976  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2494  hypothetical protein  56.21 
 
 		 169 aa  201  3e-51  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.101154 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2424  hypothetical protein  56.21 
 
 		 169 aa  201  3e-51  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.433268  normal  0.183637 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2201  hypothetical protein  56.89 
 
 		 167 aa  199  9.999999999999999e-51  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1335  hypothetical protein  56.8 
 
 		 169 aa  198  3e-50  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.72512 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0737  membrane protein  53.25 
 
 		 174 aa  196  1.0000000000000001e-49  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003989  hypothetical protein  55.03 
 
 		 169 aa  196  1.0000000000000001e-49  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01533  hypothetical protein  54.44 
 
 		 169 aa  196  1.0000000000000001e-49  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1636  hypothetical protein  55.36 
 
 		 168 aa  195  3e-49  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.687372  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1471  hypothetical protein  51.81 
 
 		 176 aa  188  2.9999999999999997e-47  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2828  hypothetical protein  55.7 
 
 		 159 aa  187  5.999999999999999e-47  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.0499107 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2123  hypothetical protein  50 
 
 		 169 aa  179  1e-44  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1367  hypothetical protein  49.12 
 
 		 174 aa  179  2e-44  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01852  flagellar biosynthesis protein FlhF  47.62 
 
 		 174 aa  177  5.999999999999999e-44  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.663944  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1778  hypothetical protein  49.7 
 
 		 180 aa  172  9.999999999999999e-43  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.728961  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1610  hypothetical protein  46.75 
 
 		 175 aa  170  9e-42  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0380399  normal  0.147771 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_25470  hypothetical protein  44.51 
 
 		 177 aa  165  2.9999999999999998e-40  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2176  hypothetical protein  43.9 
 
 		 177 aa  164  4e-40  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4179  hypothetical protein  43.2 
 
 		 172 aa  164  4e-40  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.764127 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_14720  hypothetical protein  42.01 
 
 		 175 aa  163  1.0000000000000001e-39  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  decreased coverage  0.00102497  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1507  hypothetical protein  42.6 
 
 		 208 aa  161  5.0000000000000005e-39  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3818  hypothetical protein  47.17 
 
 		 210 aa  158  3e-38  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1472  hypothetical protein  44.91 
 
 		 212 aa  155  2e-37  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1745  hypothetical protein  48.65 
 
 		 163 aa  151  5e-36  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1201  Protein of unknown function DUF2062  44.72 
 
 		 188 aa  150  1e-35  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.0952689 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0956  hypothetical protein  44.91 
 
 		 179 aa  147  7e-35  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1584  hypothetical protein  42.68 
 
 		 185 aa  145  3e-34  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.452951  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2148  hypothetical protein  43.37 
 
 		 171 aa  140  9.999999999999999e-33  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.446802 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1701  hypothetical protein  43.2 
 
 		 177 aa  136  1e-31  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.0167634 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1250  hypothetical protein  41.25 
 
 		 186 aa  136  1e-31  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2626  hypothetical protein  42.35 
 
 		 198 aa  135  3.0000000000000003e-31  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0658  Protein of unknown function DUF2062  42.01 
 
 		 179 aa  130  9e-30  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2671  hypothetical protein  48.09 
 
 		 178 aa  126  2.0000000000000002e-28  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1438  hypothetical protein  39.62 
 
 		 196 aa  111  4.0000000000000004e-24  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.244282  normal  0.395476 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0790  hypothetical protein  35.71 
 
 		 197 aa  111  5e-24  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0872806  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0784  hypothetical protein  35.16 
 
 		 197 aa  108  5e-23  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.11051  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2833  hypothetical protein  42.2 
 
 		 182 aa  107  6e-23  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0982426  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1989  hypothetical protein  38.41 
 
 		 178 aa  101  5e-21  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2507  hypothetical protein  37.14 
 
 		 198 aa  94  1e-18  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.792495  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0557  hypothetical protein  37.69 
 
 		 171 aa  89  3e-17  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.235942  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0394  hypothetical protein  32.12 
 
 		 180 aa  89  3e-17  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1643  Protein of unknown function DUF2062  34.59 
 
 		 163 aa  88.6  4e-17  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0609  hypothetical protein  29.34 
 
 		 163 aa  85.5  4e-16  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1214  hypothetical protein  33.54 
 
 		 188 aa  80.5  0.00000000000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0318  hypothetical protein  30.97 
 
 		 176 aa  69.3  0.00000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.706002  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2163  putative membrane protein with signal peptide  31.43 
 
 		 181 aa  64.3  0.0000000007  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00000423148  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1383  hypothetical protein  28.05 
 
 		 180 aa  63.9  0.000000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1729  hypothetical protein  26.16 
 
 		 221 aa  62.8  0.000000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.817068 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0515  hypothetical protein  27.59 
 
 		 191 aa  55.5  0.0000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.838084  normal  0.7935 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3586  hypothetical protein  30.89 
 
 		 165 aa  53.9  0.0000009  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000285245  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3130  hypothetical protein  33.94 
 
 		 160 aa  53.9  0.000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0121568  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2062  hypothetical protein  35.34 
 
 		 173 aa  52.8  0.000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.687582  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3294  hypothetical protein  33.33 
 
 		 168 aa  52  0.000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.943309  normal  0.515332 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3780  uncharacterized protein-like protein  33.03 
 
 		 160 aa  50.1  0.00001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0161725  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1362  hypothetical protein  27.2 
 
 		 171 aa  50.1  0.00001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4460  hypothetical protein  28.24 
 
 		 192 aa  50.1  0.00002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.10012 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0526  hypothetical protein  32.73 
 
 		 165 aa  48.1  0.00006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.983156  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2731  hypothetical protein  30.77 
 
 		 176 aa  47.4  0.00009  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_27551  hypothetical protein  30.48 
 
 		 167 aa  47  0.0001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3864  uncharacterized protein-like protein  30.28 
 
 		 160 aa  47  0.0001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0390  hypothetical protein  26.77 
 
 		 160 aa  45.4  0.0004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.371828  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1849  hypothetical protein  28.1 
 
 		 165 aa  44.7  0.0006  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4776  hypothetical protein  28.18 
 
 		 187 aa  44.7  0.0006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.146874 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1557  hypothetical protein  27.19 
 
 		 151 aa  44.3  0.0008  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1583  hypothetical protein  30.25 
 
 		 178 aa  44.3  0.0008  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4133  hypothetical protein  32.38 
 
 		 160 aa  43.1  0.002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000340149  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2454  hypothetical protein  29.69 
 
 		 146 aa  43.1  0.002  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2630  hypothetical protein  25.93 
 
 		 191 aa  42.4  0.003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.662517  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_02661  hypothetical protein  36.51 
 
 		 151 aa  42  0.004  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_02101  hypothetical protein  34.33 
 
 		 147 aa  41.6  0.006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.0337781  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>