17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ping_0592 on replicon NC_008709
Organism: Psychromonas ingrahamii 37



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008709  Ping_0592  hypothetical protein  100 
 
 
131 aa  271  3e-72  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0840  putative lipoprotein  63.85 
 
 
141 aa  177  4e-44  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0913  putative lipoprotein  64.62 
 
 
141 aa  175  2e-43  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.403622  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0819  hypothetical protein  63.85 
 
 
131 aa  175  2e-43  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0901  hypothetical protein  63.85 
 
 
141 aa  172  9e-43  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.746833  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1881  hypothetical protein  61.11 
 
 
133 aa  168  2e-41  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.779874 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3390  hypothetical protein  51.54 
 
 
131 aa  152  1e-36  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.420538 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3432  hypothetical protein  57.6 
 
 
175 aa  148  2e-35  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1600  hypothetical protein  56.92 
 
 
133 aa  147  4e-35  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.039384  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0868  hypothetical protein  48.3 
 
 
148 aa  146  1.0000000000000001e-34  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1956  hypothetical protein  59.62 
 
 
131 aa  142  1e-33  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.784413  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3278  hypothetical protein  57.55 
 
 
274 aa  139  9e-33  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0154434  hitchhiker  0.000533264 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2534  hypothetical protein  55.24 
 
 
153 aa  139  9.999999999999999e-33  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3425  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  56.19 
 
 
276 aa  134  5e-31  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1125  hypothetical protein  51.38 
 
 
162 aa  130  6.999999999999999e-30  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0743661  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2466  hypothetical protein  53.64 
 
 
192 aa  129  1.0000000000000001e-29  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2027  hypothetical protein  48.74 
 
 
163 aa  127  4.0000000000000003e-29  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000490439  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>