19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Phep_4243 on replicon NC_013061
Organism: Pedobacter heparinus DSM 2366



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013061  Phep_4243  hypothetical protein  100 
 
 
552 aa  1134    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.422157  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1049  hypothetical protein  54.77 
 
 
562 aa  617  1e-175  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0715894  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03446  putative orphan protein  55.25 
 
 
564 aa  616  1e-175  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.27433  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1178  hypothetical protein  53.35 
 
 
576 aa  613  9.999999999999999e-175  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1775  putative orphan protein  55.8 
 
 
555 aa  597  1e-169  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0483  MutT/nudix family protein  36.78 
 
 
565 aa  352  1e-95  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0516  MutT/NUDIX family protein  37.57 
 
 
565 aa  348  2e-94  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0511  MutT/NUDIX family protein  37.57 
 
 
565 aa  347  3e-94  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.203368  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0528  MutT/NUDIX family protein  38.7 
 
 
560 aa  344  2e-93  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4226  MutT/nudix family protein  34.81 
 
 
599 aa  326  8.000000000000001e-88  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.500357  normal  0.363608 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2218  hypothetical protein  34.38 
 
 
555 aa  315  1.9999999999999998e-84  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.0316012 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3447  Zn-dependent hydrolase  32.95 
 
 
574 aa  298  1e-79  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.453465 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2237  MutT/NUDIX family protein  34.61 
 
 
565 aa  298  2e-79  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0855857  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2502  hypothetical protein  33.89 
 
 
545 aa  298  2e-79  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.233242  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07015  putative dipeptidyl-peptidase III  25.88 
 
 
671 aa  66.6  0.000000001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3045  dipeptidyl-peptidase III  25.39 
 
 
706 aa  65.5  0.000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.14113 
 
 
-
 
NC_002950  PG0317  M49 family peptidase  23.72 
 
 
886 aa  63.9  0.000000007  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.620339 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2215  TPR repeat-containing protein  31.03 
 
 
177 aa  53.9  0.000008  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0824414  normal  0.0195588 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2908  hypothetical protein  22.81 
 
 
663 aa  47.4  0.0006  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.0753895 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>