22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Phep_4171 on replicon NC_013061
Organism: Pedobacter heparinus DSM 2366



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013061  Phep_4171  hypothetical protein  100 
 
 		 147 aa  293  5e-79  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  hitchhiker  0.000102963  hitchhiker  0.000000290643 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1159  hypothetical protein  46.97 
 
 		 144 aa  110  7.000000000000001e-24  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3253  hypothetical protein  46.21 
 
 		 139 aa  100  1e-20  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.0930132 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0737  hypothetical protein  41.79 
 
 		 140 aa  92.4  2e-18  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0396  hypothetical protein  41.01 
 
 		 147 aa  83.6  8e-16  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3661  hypothetical protein  36.23 
 
 		 155 aa  81.3  0.000000000000004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02620  hypothetical protein  34.06 
 
 		 147 aa  80.5  0.000000000000008  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2555  hypothetical protein  31.62 
 
 		 142 aa  74.3  0.0000000000006  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.356982  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1109  hypothetical protein  35.29 
 
 		 139 aa  73.6  0.0000000000008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.00000177487  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0897  hypothetical protein  33.33 
 
 		 154 aa  71.2  0.000000000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00141206 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5793  hypothetical protein  32.61 
 
 		 154 aa  70.5  0.000000000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2059  hypothetical protein  37.66 
 
 		 155 aa  68.9  0.00000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.535372  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0815  hypothetical protein  28.35 
 
 		 158 aa  64.7  0.0000000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000351939 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4463  hypothetical protein  28.06 
 
 		 157 aa  63.9  0.0000000007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.235508  normal  0.0116174 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2548  hypothetical protein  34.21 
 
 		 152 aa  62.8  0.000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4139  hypothetical protein  29.53 
 
 		 152 aa  62  0.000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.24606  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6869  hypothetical protein  30.37 
 
 		 165 aa  59.7  0.00000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.640003  normal  0.119892 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3775  hypothetical protein  30.66 
 
 		 155 aa  58.9  0.00000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.0018527  hitchhiker  0.00917662 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0023  hypothetical protein  34.78 
 
 		 146 aa  53.5  0.0000008  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1779  hypothetical protein  36.84 
 
 		 155 aa  53.1  0.000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000155662  normal  0.0336691 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0746  hypothetical protein  29.17 
 
 		 144 aa  52.4  0.000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0181  hypothetical protein  30.82 
 
 		 147 aa  50.4  0.000008  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  unclonable  0.000000000752164  normal  0.677539 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>