22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Phep_2083 on replicon NC_013061
Organism: Pedobacter heparinus DSM 2366



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013061  Phep_2083  hypothetical protein  100 
 
 
493 aa  1016    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.747868  normal  0.196729 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0556  hypothetical protein  58.99 
 
 
515 aa  599  1e-170  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.253273 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0558  hypothetical protein  38.78 
 
 
467 aa  340  2e-92  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.675961 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0336  hypothetical protein  39.41 
 
 
492 aa  327  2.0000000000000001e-88  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0136782  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0557  hypothetical protein  39.57 
 
 
487 aa  318  2e-85  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.398213 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2082  hypothetical protein  38.32 
 
 
476 aa  288  1e-76  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.300961  normal  0.181535 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0552  hypothetical protein  33.67 
 
 
504 aa  275  1.0000000000000001e-72  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.677753  normal  0.24778 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0550  hypothetical protein  34.18 
 
 
523 aa  273  4.0000000000000004e-72  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.40182 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0549  hypothetical protein  36.13 
 
 
542 aa  271  2e-71  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2733  hypothetical protein  32.77 
 
 
570 aa  265  1e-69  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.235032  hitchhiker  0.00174807 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0555  hypothetical protein  35.02 
 
 
442 aa  259  6e-68  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.589483  normal  0.442038 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2732  hypothetical protein  36.44 
 
 
449 aa  259  7e-68  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.799309  hitchhiker  0.00119476 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0337  hypothetical protein  34.51 
 
 
448 aa  257  4e-67  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.058195  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2081  hypothetical protein  34.43 
 
 
444 aa  249  8e-65  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0297326  normal  0.252224 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0551  hypothetical protein  32.76 
 
 
501 aa  245  1.9999999999999999e-63  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.42028 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1617  hypothetical protein  34.87 
 
 
579 aa  236  5.0000000000000005e-61  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.885504 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0548  hypothetical protein  34.54 
 
 
390 aa  230  3e-59  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1618  hypothetical protein  35.39 
 
 
475 aa  222  9.999999999999999e-57  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.483238  normal  0.382765 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5342  hypothetical protein  32.35 
 
 
426 aa  131  3e-29  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0256  DoxX family protein  26.49 
 
 
448 aa  80.5  0.00000000000006  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014159  Tpau_4334  hypothetical protein  22.9 
 
 
445 aa  59.3  0.0000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.163253  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0868  hypothetical protein  21.53 
 
 
459 aa  53.5  0.000008  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>