22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Phep_2082 on replicon NC_013061
Organism: Pedobacter heparinus DSM 2366



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013061  Phep_2082  hypothetical protein  100 
 
 
476 aa  981    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.300961  normal  0.181535 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0557  hypothetical protein  62.92 
 
 
487 aa  630  1e-179  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.398213 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0336  hypothetical protein  39.87 
 
 
492 aa  323  3e-87  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0136782  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0556  hypothetical protein  37.4 
 
 
515 aa  315  9.999999999999999e-85  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.253273 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2083  hypothetical protein  37.72 
 
 
493 aa  311  1e-83  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.747868  normal  0.196729 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0552  hypothetical protein  35.23 
 
 
504 aa  301  1e-80  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.677753  normal  0.24778 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0550  hypothetical protein  39.05 
 
 
523 aa  301  2e-80  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.40182 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0549  hypothetical protein  39.56 
 
 
542 aa  299  7e-80  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0558  hypothetical protein  36.23 
 
 
467 aa  295  2e-78  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.675961 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1617  hypothetical protein  39.57 
 
 
579 aa  281  1e-74  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.885504 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2733  hypothetical protein  38.14 
 
 
570 aa  282  1e-74  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.235032  hitchhiker  0.00174807 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0551  hypothetical protein  34.06 
 
 
501 aa  276  6e-73  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.42028 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0555  hypothetical protein  33.92 
 
 
442 aa  250  4e-65  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.589483  normal  0.442038 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2081  hypothetical protein  33.26 
 
 
444 aa  239  5e-62  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0297326  normal  0.252224 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0337  hypothetical protein  34.69 
 
 
448 aa  238  2e-61  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.058195  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2732  hypothetical protein  32.17 
 
 
449 aa  225  1e-57  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.799309  hitchhiker  0.00119476 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1618  hypothetical protein  31.77 
 
 
475 aa  216  5.9999999999999996e-55  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.483238  normal  0.382765 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0548  hypothetical protein  34.84 
 
 
390 aa  203  6e-51  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5342  hypothetical protein  26.48 
 
 
426 aa  101  3e-20  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0256  DoxX family protein  26.12 
 
 
448 aa  71.6  0.00000000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0868  hypothetical protein  26.89 
 
 
459 aa  47.8  0.0004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014159  Tpau_4334  hypothetical protein  28.3 
 
 
445 aa  46.6  0.001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.163253  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>