22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Phep_0897 on replicon NC_013061
Organism: Pedobacter heparinus DSM 2366



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013061  Phep_0897  hypothetical protein  100 
 
 		 154 aa  312  9e-85  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00141206 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3661  hypothetical protein  47.1 
 
 		 155 aa  145  3e-34  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5793  hypothetical protein  46.75 
 
 		 154 aa  141  3e-33  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4139  hypothetical protein  47.1 
 
 		 152 aa  138  3e-32  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.24606  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2548  hypothetical protein  50.66 
 
 		 152 aa  137  7.999999999999999e-32  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3775  hypothetical protein  38.82 
 
 		 155 aa  114  5e-25  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.0018527  hitchhiker  0.00917662 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4463  hypothetical protein  32.41 
 
 		 157 aa  81.3  0.000000000000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.235508  normal  0.0116174 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0815  hypothetical protein  28 
 
 		 158 aa  79  0.00000000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000351939 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0181  hypothetical protein  33.1 
 
 		 147 aa  78.6  0.00000000000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  unclonable  0.000000000752164  normal  0.677539 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6869  hypothetical protein  29.05 
 
 		 165 aa  75.9  0.0000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.640003  normal  0.119892 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0737  hypothetical protein  34.75 
 
 		 140 aa  73.2  0.000000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3253  hypothetical protein  35.86 
 
 		 139 aa  73.2  0.000000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.0930132 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02620  hypothetical protein  32.62 
 
 		 147 aa  71.6  0.000000000003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1159  hypothetical protein  34.97 
 
 		 144 aa  71.6  0.000000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2555  hypothetical protein  34.75 
 
 		 142 aa  71.6  0.000000000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.356982  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2059  hypothetical protein  30.32 
 
 		 155 aa  68.9  0.00000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.535372  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0023  hypothetical protein  32.14 
 
 		 146 aa  68.2  0.00000000004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0396  hypothetical protein  32.87 
 
 		 147 aa  65.5  0.0000000002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0746  hypothetical protein  27.86 
 
 		 144 aa  57  0.0000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1779  hypothetical protein  30.92 
 
 		 155 aa  55.8  0.0000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000155662  normal  0.0336691 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1109  hypothetical protein  30.4 
 
 		 139 aa  54.7  0.0000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.00000177487  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4171  hypothetical protein  32.81 
 
 		 147 aa  52.8  0.000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  hitchhiker  0.000102963  hitchhiker  0.000000290643 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>