17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Phep_0555 on replicon NC_013061
Organism: Pedobacter heparinus DSM 2366



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013061  Phep_0555  Lanthionine synthetase C family protein  100 
 
 		 409 aa  838    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0882102 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1439  Lanthionine synthetase C family protein  33.77 
 
 		 404 aa  204  2e-51  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3397  Lanthionine synthetase C family protein  31.23 
 
 		 391 aa  142  9.999999999999999e-33  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.829855  normal  0.741439 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4144  Lanthionine synthetase C family protein  34.59 
 
 		 491 aa  135  1.9999999999999998e-30  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.732259  normal  0.0439523 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3102  Lanthionine synthetase C family protein  28.47 
 
 		 466 aa  128  2.0000000000000002e-28  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.220551 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4705  Lanthionine synthetase C family protein  25.91 
 
 		 414 aa  127  3e-28  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4693  Lanthionine synthetase C family protein  23.65 
 
 		 385 aa  58.9  0.0000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.205081  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1333  lanthionine synthetase C family protein  23.67 
 
 		 436 aa  59.7  0.0000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.551355  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3314  hypothetical protein  25.59 
 
 		 381 aa  56.2  0.000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.111602 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1822  hypothetical protein  23.63 
 
 		 408 aa  52.8  0.00001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.961315  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1126  lanthionine synthetase C-like  25.43 
 
 		 405 aa  52.8  0.00001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4228  Lanthionine synthetase C family protein  28.99 
 
 		 661 aa  48.9  0.0002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3603  Lanthionine synthetase C family protein  31.85 
 
 		 409 aa  48.5  0.0002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.853914 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0603  lanthionine synthetase C family protein  20.89 
 
 		 420 aa  45.4  0.002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0205  hypothetical protein  25.88 
 
 		 412 aa  45.4  0.002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.0827399 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4648  Lanthionine synthetase C family protein  28.98 
 
 		 390 aa  43.5  0.006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6754  lanthionine synthetase C family protein  24.71 
 
 		 358 aa  43.1  0.01  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.49413 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>