17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Phep_0231 on replicon NC_013061
Organism: Pedobacter heparinus DSM 2366



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013061  Phep_0231  hypothetical protein  100 
 
 		 114 aa  229  1e-59  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2507  hypothetical protein  41.54 
 
 		 94 aa  59.3  0.00000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.305413  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2234  hypothetical protein  40.91 
 
 		 221 aa  51.2  0.000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00687189 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_27251  hypothetical protein  38.55 
 
 		 126 aa  49.3  0.00002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5433  hypothetical protein  34.85 
 
 		 141 aa  48.1  0.00004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00625909  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08591  hypothetical protein  32.18 
 
 		 90 aa  47  0.00008  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.515536  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1885  hypothetical protein  40.79 
 
 		 139 aa  46.2  0.0001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0572068  normal  0.900072 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0371  hypothetical protein  42.11 
 
 		 145 aa  46.6  0.0001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  2.37992e-22  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2433  hypothetical protein  40 
 
 		 120 aa  45.8  0.0002  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.0955395  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5672  hypothetical protein  52.5 
 
 		 124 aa  43.9  0.0008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3461  hypothetical protein  27.91 
 
 		 166 aa  43.1  0.001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.239912  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0308  hypothetical protein  34.74 
 
 		 112 aa  42.4  0.002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000000160986  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2222  hypothetical protein  48.72 
 
 		 150 aa  42.7  0.002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3594  hypothetical protein  50 
 
 		 136 aa  42  0.003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.32654  normal  0.529723 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4717  hypothetical protein  43.14 
 
 		 140 aa  41.6  0.003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.729727  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6425  hypothetical protein  35.09 
 
 		 154 aa  41.6  0.004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0847  hypothetical protein  45.45 
 
 		 170 aa  40.4  0.007  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>