48 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pfl01_5028 on replicon NC_007492
Organism: Pseudomonas fluorescens Pf0-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007492  Pfl01_5028  putative lipoprotein  100 
 
 		 172 aa  345  1e-94  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.638371 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0558  lipoprotein  68.24 
 
 		 171 aa  244  3e-64  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.950452  normal  0.717571 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4472  putative lipoprotein  71.51 
 
 		 174 aa  241  5e-63  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0550  lipoprotein  68.59 
 
 		 190 aa  234  6e-61  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.916886 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0505  putative lipoprotein  70.78 
 
 		 212 aa  233  8e-61  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0127462  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0680  lipoprotein, putative  74.52 
 
 		 174 aa  232  1.0000000000000001e-60  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0540  hypothetical protein  70.13 
 
 		 177 aa  232  2.0000000000000002e-60  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3866  hypothetical protein  69.54 
 
 		 173 aa  222  2e-57  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_11280  hypothetical protein  60.93 
 
 		 172 aa  179  1e-44  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1036  hypothetical protein  60.93 
 
 		 172 aa  179  2e-44  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_06620  hypothetical protein  61.04 
 
 		 171 aa  179  2e-44  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.600146  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1814  hypothetical protein  34.59 
 
 		 189 aa  130  1.0000000000000001e-29  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.660387  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_71580  hypothetical protein  43.42 
 
 		 182 aa  120  6e-27  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_01230  hypothetical protein  40.83 
 
 		 195 aa  119  1.9999999999999998e-26  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0142  hypothetical protein  38.32 
 
 		 153 aa  119  3e-26  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.143516  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00217  lipoprotein, putative  51.46 
 
 		 158 aa  118  3e-26  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6211  hypothetical protein  42.11 
 
 		 182 aa  118  3.9999999999999996e-26  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5045  hypothetical protein  41.33 
 
 		 180 aa  117  7.999999999999999e-26  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.110017 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0141  hypothetical protein  37.57 
 
 		 177 aa  116  9.999999999999999e-26  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5491  hypothetical protein  41.33 
 
 		 182 aa  116  9.999999999999999e-26  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5619  hypothetical protein  41.45 
 
 		 197 aa  116  9.999999999999999e-26  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.774523  normal  0.643445 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0305  hypothetical protein  35.4 
 
 		 193 aa  116  1.9999999999999998e-25  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0115  hypothetical protein  42.57 
 
 		 178 aa  115  3.9999999999999997e-25  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3492  hypothetical protein  39.35 
 
 		 214 aa  114  6.9999999999999995e-25  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1973  hypothetical protein  40.62 
 
 		 232 aa  113  2.0000000000000002e-24  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1562  hypothetical protein  40.79 
 
 		 213 aa  111  5e-24  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.410423  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1829  hypothetical protein  37.95 
 
 		 203 aa  105  3e-22  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3393  hypothetical protein  36.13 
 
 		 184 aa  105  4e-22  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.191739  normal  0.131227 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2156  hypothetical protein  34.19 
 
 		 183 aa  102  2e-21  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.811392 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3556  hypothetical protein  38.06 
 
 		 190 aa  102  2e-21  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.171808 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3430  hypothetical protein  33.33 
 
 		 171 aa  102  2e-21  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0703  hypothetical protein  35.62 
 
 		 204 aa  102  3e-21  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00895458  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5333  hypothetical protein  37.79 
 
 		 189 aa  98.2  5e-20  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00441093 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5241  hypothetical protein  37.79 
 
 		 177 aa  98.2  5e-20  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.98466  normal  0.106495 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001702  hypothetical protein  35.23 
 
 		 164 aa  97.8  6e-20  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5382  hypothetical protein  39.33 
 
 		 177 aa  97.1  1e-19  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.246443 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00771  hypothetical protein  35.93 
 
 		 164 aa  95.5  3e-19  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2133  hypothetical protein  34.48 
 
 		 173 aa  95.5  3e-19  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0425  hypothetical protein  43.43 
 
 		 161 aa  94  8e-19  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2155  hypothetical protein  41.24 
 
 		 206 aa  89.4  2e-17  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4181  hypothetical protein  38.3 
 
 		 155 aa  85.9  2e-16  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.526119 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1843  hypothetical protein  34.48 
 
 		 192 aa  86.7  2e-16  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05705  hypothetical protein  41.58 
 
 		 210 aa  83.2  0.000000000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2285  hypothetical protein  28.87 
 
 		 218 aa  79  0.00000000000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3621  hypothetical protein  33.87 
 
 		 151 aa  78.2  0.00000000000006  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0303  hypothetical protein  29.6 
 
 		 219 aa  69.7  0.00000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.965134  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3013  hypothetical protein  33.98 
 
 		 239 aa  66.6  0.0000000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.195597  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4728  hypothetical protein  31.46 
 
 		 185 aa  52.8  0.000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>