22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pfl01_2091 on replicon NC_007492
Organism: Pseudomonas fluorescens Pf0-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007492  Pfl01_2091  hypothetical protein  100 
 
 		 90 aa  187  2.9999999999999997e-47  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0395312  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4336  hypothetical protein  72.22 
 
 		 90 aa  148  3e-35  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.022904  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5720  hypothetical protein  67.78 
 
 		 90 aa  146  8e-35  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.470242  normal  0.791628 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0894  hypothetical protein  70 
 
 		 90 aa  144  3e-34  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00183124  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3576  hypothetical protein  68.89 
 
 		 90 aa  142  2e-33  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.221494  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2131  hypothetical protein  64.44 
 
 		 91 aa  139  9.999999999999999e-33  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1286  hypothetical protein  63.33 
 
 		 90 aa  135  2e-31  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.3216500000000004e-18 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1705  hypothetical protein  57.78 
 
 		 91 aa  130  6.999999999999999e-30  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4610  hypothetical protein  60 
 
 		 90 aa  128  3e-29  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.553384  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2189  hypothetical protein  58.89 
 
 		 90 aa  124  5e-28  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1968  hypothetical protein  57.78 
 
 		 92 aa  124  5e-28  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1930  hypothetical protein  52.81 
 
 		 93 aa  102  2e-21  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5212  hypothetical protein  46.67 
 
 		 95 aa  97.1  8e-20  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5917  hypothetical protein  46.67 
 
 		 93 aa  94.4  5e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.567263  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2377  hypothetical protein  46.07 
 
 		 90 aa  94  7e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0704345  hitchhiker  0.00399163 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0406  hypothetical protein  32.58 
 
 		 88 aa  55.1  0.0000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3192  hypothetical protein  33.33 
 
 		 91 aa  51.6  0.000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3546  hypothetical protein  34.09 
 
 		 91 aa  51.6  0.000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0703945  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3283  hypothetical protein  40 
 
 		 106 aa  48.5  0.00003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.114531  normal  0.185458 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2065  hypothetical protein  32.95 
 
 		 103 aa  47.8  0.00005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6474  hypothetical protein  30.34 
 
 		 86 aa  46.6  0.0001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.151582  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5182  hypothetical protein  33.72 
 
 		 85 aa  42.4  0.002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.870922  normal  0.271162 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>