12 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pfl01_1586 on replicon NC_007492
Organism: Pseudomonas fluorescens Pf0-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007492  Pfl01_1586  hypothetical protein  100 
 
 		 135 aa  273  8e-73  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.189764  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3887  hypothetical protein  60.84 
 
 		 138 aa  159  2e-38  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1549  hypothetical protein  59.71 
 
 		 138 aa  157  6e-38  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.51035  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4319  hypothetical protein  60.43 
 
 		 138 aa  155  1e-37  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.860691  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3644  hypothetical protein  56.25 
 
 		 139 aa  151  2.9999999999999998e-36  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0205183  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3626  lipoprotein, putative  60.9 
 
 		 135 aa  142  1e-33  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3384  putative lipoprotein  60 
 
 		 135 aa  134  3.0000000000000003e-31  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.112381  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3843  putative lipoprotein  50.42 
 
 		 137 aa  106  9.000000000000001e-23  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2782  hypothetical protein  39.85 
 
 		 121 aa  94  7e-19  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.981039  normal  0.95643 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_45260  hypothetical protein  48.45 
 
 		 144 aa  92.4  2e-18  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_30360  hypothetical protein  41.94 
 
 		 155 aa  74.7  0.0000000000004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3121  hypothetical protein  38.98 
 
 		 108 aa  42.7  0.002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.310321  normal  0.0170994 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>