20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pfl01_1161 on replicon NC_007492
Organism: Pseudomonas fluorescens Pf0-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007492  Pfl01_1161  Phage FluMu protein gp46  100 
 
 		 132 aa  264  4e-70  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4588  Phage GP46  61.36 
 
 		 132 aa  150  8e-36  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3861  phage FluMu protein gp46  54.92 
 
 		 128 aa  107  6e-23  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2252  phage protein GP46  50 
 
 		 137 aa  107  6e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00086337 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4480  phage protein GP46  50 
 
 		 137 aa  107  7.000000000000001e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00228565 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2249  phage protein GP46  50 
 
 		 137 aa  107  7.000000000000001e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.213906 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2585  phage GP46 family protein  50.47 
 
 		 141 aa  94.7  4e-19  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.135716 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3114  GP46 family protein  52.69 
 
 		 145 aa  84.7  4e-16  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2734  phage protein GP46  55.95 
 
 		 151 aa  83.6  8e-16  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.86914  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1045  phage protein GP46  50.46 
 
 		 145 aa  83.6  8e-16  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1472  phage protein GP46  55.95 
 
 		 151 aa  83.6  8e-16  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.376709 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2812  GP46 family protein  55.95 
 
 		 151 aa  83.6  8e-16  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3734  phage GP46  52.75 
 
 		 155 aa  83.6  9e-16  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1871  GP46 family protein  44.63 
 
 		 405 aa  82  0.000000000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.881976  hitchhiker  0.000000000000640584 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2085  phage protein GP46  51.55 
 
 		 149 aa  79  0.00000000000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3048  putative bacteriophage protein GP46, Mu-like  44.86 
 
 		 149 aa  78.2  0.00000000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000162081 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2701  hypothetical protein  33.33 
 
 		 151 aa  61.2  0.000000004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0742  phage protein GP46  33.33 
 
 		 149 aa  53.9  0.0000008  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0695  phage protein GP46  33.33 
 
 		 149 aa  53.9  0.0000008  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4483  GP46 family protein  38.46 
 
 		 150 aa  49.7  0.00001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.185083 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>