12 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pfl01_0539 on replicon NC_007492
Organism: Pseudomonas fluorescens Pf0-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007492  Pfl01_0539  hypothetical protein  100 
 
 		 859 aa  1761    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.309722 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5009  hypothetical protein  30.49 
 
 		 1586 aa  71.2  0.00000000007  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.572678  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4883  hypothetical protein  31.31 
 
 		 1586 aa  69.3  0.0000000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.718638 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3453  hypothetical protein  31.62 
 
 		 1527 aa  65.1  0.000000006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.173226 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5111  hypothetical protein  37.21 
 
 		 1559 aa  63.5  0.00000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0266  hypothetical protein  26.38 
 
 		 1830 aa  62.4  0.00000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.639279  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0405  hypothetical protein  34.07 
 
 		 1555 aa  59.3  0.0000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.354945 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0234  hypothetical protein  38.58 
 
 		 472 aa  56.6  0.000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0603115  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4933  hypothetical protein  24.73 
 
 		 1530 aa  57  0.000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5059  hypothetical protein  29.89 
 
 		 1565 aa  57  0.000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5060  hypothetical protein  24.64 
 
 		 1571 aa  55.1  0.000005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.572678  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4544  hypothetical protein  31.05 
 
 		 1844 aa  54.3  0.000008  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.516269 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>