18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pfl01_0475 on replicon NC_007492
Organism: Pseudomonas fluorescens Pf0-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007492  Pfl01_0475  Mig-14  100 
 
 		 298 aa  607  9.999999999999999e-173  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.496349  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0530  Mig-14  82.21 
 
 		 298 aa  511  1e-144  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0825509  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4990  hypothetical protein  81.54 
 
 		 298 aa  507  9.999999999999999e-143  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0526  Mig-14 family protein  79.39 
 
 		 298 aa  498  1e-140  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.254564  normal  0.164159 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4942  Mig-14 family protein  80.74 
 
 		 298 aa  498  1e-140  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4814  Mig-14 family protein  81.08 
 
 		 298 aa  498  1e-140  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4991  Mig-14 family protein  80.41 
 
 		 298 aa  494  1e-139  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5738  hypothetical protein  76.17 
 
 		 298 aa  464  9.999999999999999e-131  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_66150  hypothetical protein  75.5 
 
 		 298 aa  462  1e-129  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0595  Mig-14 family protein  67.45 
 
 		 298 aa  427  1e-118  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_44700  Mig-14 family protein  59.4 
 
 		 298 aa  373  1e-102  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.390095  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2924  Mig-14  27.72 
 
 		 298 aa  120  3e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.0632699 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2958  hypothetical protein  27.87 
 
 		 298 aa  117  1.9999999999999998e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.127053  hitchhiker  0.0000324409 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2893  Mig-14  27.87 
 
 		 298 aa  117  1.9999999999999998e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3080  Mig-14  27.87 
 
 		 298 aa  117  1.9999999999999998e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2977  hypothetical protein  27.53 
 
 		 298 aa  117  3e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.291732 
 
 
-
 
NC_010488  EcSMS35_A0097  Mig-14 family protein  26.37 
 
 		 302 aa  110  3e-23  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.028214  hitchhiker  0.0000000164486 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1493  Mig-14 family protein  27.49 
 
 		 296 aa  105  1e-21  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.66727  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>