17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pfl01_0355 on replicon NC_007492
Organism: Pseudomonas fluorescens Pf0-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007492  Pfl01_0355  putative lipoprotein  100 
 
 		 84 aa  170  6.999999999999999e-42  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0369  putative lipoprotein  84.52 
 
 		 84 aa  152  1e-36  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5169  lipoprotein, putative  80.95 
 
 		 84 aa  149  1e-35  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_67460  putative lipoprotein  77.11 
 
 		 85 aa  143  8.000000000000001e-34  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.52658  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5841  putative lipoprotein  75.9 
 
 		 85 aa  140  8e-33  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0426  lipoprotein  83.56 
 
 		 84 aa  130  5e-30  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.613355  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5038  hypothetical protein  82.19 
 
 		 84 aa  129  1.0000000000000001e-29  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5088  hypothetical protein  82.19 
 
 		 84 aa  129  1.0000000000000001e-29  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.614342  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4912  hypothetical protein  82.19 
 
 		 84 aa  129  1.0000000000000001e-29  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_45630  hypothetical protein  70.59 
 
 		 84 aa  125  2.0000000000000002e-28  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.856651  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0510  hypothetical protein  77.27 
 
 		 83 aa  113  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2268  hypothetical protein  35.37 
 
 		 82 aa  77.8  0.00000000000004  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.458864  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0950  hypothetical protein  49.25 
 
 		 86 aa  77  0.00000000000008  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0248  hypothetical protein  42.5 
 
 		 86 aa  75.5  0.0000000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.727714  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0311  putative lipoprotein  41.98 
 
 		 90 aa  73.2  0.000000000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02511  hypothetical protein  40 
 
 		 100 aa  65.5  0.0000000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.441191  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0433  hypothetical protein  37.5 
 
 		 102 aa  55.1  0.0000004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  5.4404e-16  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>