29 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pecwa_0655 on replicon NC_013421
Organism: Pectobacterium wasabiae WPP163



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013421  Pecwa_0655  hypothetical protein  100 
 
 
124 aa  246  9e-65  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3710  hypothetical protein  61.48 
 
 
124 aa  159  2e-38  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.802299  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4174  hypothetical protein  50.42 
 
 
121 aa  117  7.999999999999999e-26  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4091  hypothetical protein  50.42 
 
 
121 aa  117  7.999999999999999e-26  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0332  hypothetical protein  51.67 
 
 
121 aa  116  7.999999999999999e-26  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.134237 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3018  hypothetical protein  38.26 
 
 
137 aa  68.6  0.00000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1631  hypothetical protein  36 
 
 
132 aa  67  0.00000000008  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1189  hypothetical protein  38.84 
 
 
136 aa  66.2  0.0000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.651211  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4174  hypothetical protein  38.52 
 
 
136 aa  64.7  0.0000000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  hitchhiker  0.00950155  normal  0.900002 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0440  hypothetical protein  36 
 
 
132 aa  64.7  0.0000000004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.477088  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3419  hypothetical protein  37.19 
 
 
136 aa  64.7  0.0000000004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.399009  normal  0.0716917 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2389  hypothetical protein  42.22 
 
 
136 aa  64.3  0.0000000005  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.84186  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1169  hypothetical protein  38.84 
 
 
136 aa  64.3  0.0000000005  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2348  hypothetical protein  38.84 
 
 
132 aa  64.3  0.0000000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00000206285  unclonable  0.000000125887 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0953  hypothetical protein  40.45 
 
 
136 aa  63.9  0.0000000006  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3325  hypothetical protein  42.24 
 
 
133 aa  63.9  0.0000000007  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1403  hypothetical protein  37.4 
 
 
132 aa  63.2  0.000000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.16111  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1261  hypothetical protein  37.4 
 
 
132 aa  63.2  0.000000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2191  hypothetical protein  41.11 
 
 
136 aa  62.4  0.000000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2854  hypothetical protein  35.48 
 
 
132 aa  61.2  0.000000004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.284991  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2943  hypothetical protein  40.18 
 
 
133 aa  60.8  0.000000005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1759  hypothetical protein  38.2 
 
 
122 aa  59.7  0.00000001  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0678  hypothetical protein  37.4 
 
 
142 aa  54.3  0.0000005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.450088  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1447  hypothetical protein  29.6 
 
 
130 aa  53.1  0.000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.111651 
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_3931  hypothetical protein  31.71 
 
 
135 aa  51.2  0.000004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0866  hypothetical protein  32.67 
 
 
121 aa  48.1  0.00004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4510  hypothetical protein  30.25 
 
 
128 aa  46.6  0.0001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_59890  hypothetical protein  28.81 
 
 
128 aa  44.7  0.0005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0571428  hitchhiker  0.00000000000107847 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0507  hypothetical protein  34.07 
 
 
152 aa  43.1  0.001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>