31 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pden_3172 on replicon NC_008687
Organism: Paracoccus denitrificans PD1222



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008687  Pden_3172  hypothetical protein  100 
 
 		 148 aa  301  1.0000000000000001e-81  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.868488 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0527  hypothetical protein  58.33 
 
 		 88 aa  105  2e-22  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.631272  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3180  hypothetical protein  59.04 
 
 		 92 aa  105  2e-22  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0603995  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0578  hypothetical protein  62.82 
 
 		 86 aa  104  5e-22  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0767023  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3072  hypothetical protein  59.04 
 
 		 88 aa  103  8e-22  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.288169  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4018  hypothetical protein  61.54 
 
 		 85 aa  103  8e-22  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.835397  normal  0.0668593 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3527  hypothetical protein  67.57 
 
 		 86 aa  102  1e-21  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.239043  normal  0.797206 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1208  hypothetical protein  67.57 
 
 		 86 aa  102  1e-21  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7726  hypothetical protein  56.47 
 
 		 85 aa  101  3e-21  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0513086  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0713  hypothetical protein  66.67 
 
 		 91 aa  101  3e-21  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.39863  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2865  hypothetical protein  65.75 
 
 		 91 aa  99.8  1e-20  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.064843  normal  0.0210484 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3019  hypothetical protein  55 
 
 		 88 aa  99.8  1e-20  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3680  hypothetical protein  60.81 
 
 		 87 aa  96.7  1e-19  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3836  hypothetical protein  52.94 
 
 		 90 aa  96.7  1e-19  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.071209  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3813  hypothetical protein  49.4 
 
 		 87 aa  94.7  4e-19  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.720082 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0762  hypothetical protein  61.64 
 
 		 91 aa  94  6e-19  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1516  hypothetical protein  55.26 
 
 		 87 aa  91.3  4e-18  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.184159 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0844  hypothetical protein  51.19 
 
 		 88 aa  90.1  8e-18  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.0110114 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3343  hypothetical protein  50.62 
 
 		 92 aa  90.1  9e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0429346  normal  0.933804 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2794  hypothetical protein  56.94 
 
 		 87 aa  89.4  2e-17  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.617961  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0129  hypothetical protein  52.5 
 
 		 87 aa  88.2  4e-17  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.280117  normal  0.660768 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3367  hypothetical protein  52.5 
 
 		 87 aa  87.4  6e-17  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.104569 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0367  hypothetical protein  51.22 
 
 		 87 aa  87  7e-17  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3913  hypothetical protein  47.67 
 
 		 92 aa  85.1  3e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1486  hypothetical protein  49.4 
 
 		 95 aa  84  6e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7428  hypothetical protein  51.32 
 
 		 92 aa  83.6  8e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0968962 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1980  hypothetical protein  47.62 
 
 		 90 aa  82.8  0.000000000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.902774 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3549  hypothetical protein  48.72 
 
 		 99 aa  79.3  0.00000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.242285  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1038  hypothetical protein  47.44 
 
 		 92 aa  73.9  0.0000000000007  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0983054  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1811  hypothetical protein  47.44 
 
 		 91 aa  73.2  0.000000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.465355  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2328  hypothetical protein  43.21 
 
 		 100 aa  72  0.000000000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.340966  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>