20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pden_3002 on replicon NC_008687
Organism: Paracoccus denitrificans PD1222



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008687  Pden_3002  von Willebrand factor, type A  100 
 
 		 267 aa  533  1e-150  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0120219  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4623  von Willebrand factor type A  51.69 
 
 		 336 aa  214  8e-55  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.22995  normal  0.878919 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4509  von Willebrand factor type A  51.49 
 
 		 331 aa  214  1.9999999999999998e-54  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.720482 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4141  von Willebrand factor type A  51.91 
 
 		 335 aa  213  1.9999999999999998e-54  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0480  von Willebrand factor type A  46.24 
 
 		 342 aa  210  2e-53  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8031  von Willebrand factor type A  52.99 
 
 		 334 aa  207  2e-52  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4201  von Willebrand factor type A  50 
 
 		 351 aa  204  9e-52  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.564539  normal  0.475934 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1916  von Willebrand factor, type A  49.34 
 
 		 322 aa  194  2e-48  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0788  MxaL protein, putative  41.49 
 
 		 323 aa  161  8.000000000000001e-39  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.169917  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1891  MxaL protein, putative  37.9 
 
 		 353 aa  127  3e-28  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0479077 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2416  putative MxaL-like protein  37.02 
 
 		 317 aa  119  4.9999999999999996e-26  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.345255  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1820  hypothetical protein  36.96 
 
 		 364 aa  119  6e-26  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4028  putative MxaL-like protein  35.68 
 
 		 316 aa  117  1.9999999999999998e-25  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.17942  normal  0.71996 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1530  MxaL protein, putative  35.62 
 
 		 308 aa  116  3e-25  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.766517  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3806  putative MxaL-like protein  33.84 
 
 		 320 aa  114  2.0000000000000002e-24  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3052  MxaL protein, putative  33.05 
 
 		 332 aa  113  3e-24  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.660089  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3273  MxaL protein, putative  35.11 
 
 		 309 aa  110  2.0000000000000002e-23  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2035  MxaL protein, putative  30.8 
 
 		 342 aa  107  2e-22  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1900  von Willebrand factor, type A  28.93 
 
 		 321 aa  102  9e-21  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.523701 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0692  von Willebrand factor, type A  27.27 
 
 		 324 aa  99.4  5e-20  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>